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Nanoporen-Sequenzierung

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Nanopore-Sequenzierung

Nanopore-Sequenzierung ist ein Sequenzierungsverfahren, bei dem einzelne DNS- oder RNA-Moleküle durch Nanoporen passieren und Signaländerungen erzeugen, die als Sequenzinformation interpretiert werden können.

Merkmale

  • Lange Reads, die bei der Genomanalyse und der Erkennung struktureller Varianten helfen können.
  • Echtzeit-Datenerzeugung und -analyse.
  • Direktes DNS- oder RNA-Erkennen in vielen Arbeitsabläufen.
  • Portabelle Geräte, die für Einsatz vor Ort und in Krisensituationen geeignet sind.

Üblicher Arbeitsablauf

  1. Probenaufbereitung und Bibliothekserschließung.
  2. Sequenzierung auf einem Nanopore-Gerät.
  3. Basecalling vom Rohsignal zum Nukleotidsequenz.
  4. Qualitätskontrolle und Filterung.
  5. Anpassung, Assemblierung, Variante Erkennung oder Metagenom-Klassifizierung.
  6. Interpretation und Berichterstattung.

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