牛津納米孔
Oxford Nanopore 是 Nanopore Wiki 學習路徑的一部分。Oxford Nanopore Technologies 開發了納米孔測序儀器、流動池、化學試劑和軟體，用於實時 DNA 和 RNA 測序。
核心概念
- 該平台讀取分子通過納米孔時產生的電信號。
- 設備家族包括可攜式和高吞吐量的儀器。
- 輸出可以包括原始信號文件、鹼基呼叫讀取、比對結果和分析報告。
- 性能取決於化學、流動池質量、文庫製備、鹼基識別模型和分析設置。
典型的測序工作流程
| 步驟 | 描述 |
|---|---|
| 1 | 根據檢測方法準備DNA或RNA文庫。 |
| 2 | 將文庫加載到流動池上並開始測序。 |
| 3 | 將原始信號轉換為序列讀取和質量分數。 |
| 4 | 運行質量控制、比對、組裝、變異調用、修飾調用或分類。 |
典型應用
- 長讀長基因組測序。
- 元基因組學和病原體監測。
- 轉錄組學和直接RNA測序。
- 結構變異和修飾檢測。