Bioinformatik
Bioinformatik
Bioinformatik in der Nanopore-Forschung umfasst die rechnergestützten Schritte, die rohe Nanopore-Signale und -Sequenzen in interpretierbare biologische oder technische Ergebnisse umwandeln.
Hauptaufgaben
- Basecalling von rohem Signal in Sequenzleseabschnitte.
- Qualitätskontrolle und Filterung der Leseabschnitte.
- Abbildung der Leseabschnitte auf Referenzgenomen.
- De Novo-Genombestimmung.
- Varianteinschätzung und Analyse struktureller Varianten.
- Taxonomische Klassifizierung für Metagenomik und Erregererkennung.
- Methylierungs- und andere Modifikationsanalysen.
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