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Bioinformática

From Nanopore Wiki
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Bioinformática

Bioinformática en la investigación de nanoporos cubre los pasos computacionales que transforman las señales y lecturas de nanoporos en resultados biológicos o técnicos interpretables.

Tareas clave

  • Conversión de la señal cruda en lecturas de secuencia.
  • Control de calidad y filtrado de lecturas.
  • Mapeo de lecturas a genomas de referencia.
  • Ensamblaje de genomas de novo.
  • Llamada de variantes y análisis de variantes estructurales.
  • Clasificación taxonómica para metagenómica y detección de patógenos.
  • Análisis de metilación y otras modificaciones.

Notas para esta wiki

Las páginas de bioinformática deben incluir nombres de herramientas, formatos de entrada y salida, suposiciones, modos de fallo comunes y enlaces a flujos de trabajo reproducibles cuando estén disponibles.

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