Bioinformatique
Bioinformatique
Bioinformatique dans la recherche sur les nanopores couvre les étapes computationnelles qui transforment les signaux et lectures brutes des nanopores en résultats biologiques ou techniques interprétables.
Tâches clés
- Conversion du signal brut en lectures de séquence.
- Contrôle de qualité et filtrage des lectures.
- Mappage des lectures sur des génomes de référence.
- Assemblage de génome de novo.
- Appel de variantes et analyse de variantes structurelles.
- Classification taxonomique pour la métagénomique et la détection de pathogènes.
- Analyse de la méthylation et d'autres modifications.
Notes pour cette wiki
Les pages de bioinformatique doivent inclure les noms des outils, les formats d'entrée et de sortie, les hypothèses, les modes de défaillance courants, et des liens vers des workflows reproductibles lorsque disponibles.