Nanoporen-Sequenzierung
Nanopore-Sequenzierung
Nanopore-Sequenzierung ist ein Sequenzierungsverfahren, bei dem einzelne DNS- oder RNA-Moleküle durch Nanoporen passieren und Signaländerungen erzeugen, die als Sequenzinformation interpretiert werden können.
Merkmale
- Lange Reads, die bei der Genomanalyse und der Erkennung struktureller Varianten helfen können.
- Echtzeit-Datenerzeugung und -analyse.
- Direktes DNS- oder RNA-Erkennen in vielen Arbeitsabläufen.
- Portabelle Geräte, die für Einsatz vor Ort und in Krisensituationen geeignet sind.
Üblicher Arbeitsablauf
- Probenaufbereitung und Bibliothekserschließung.
- Sequenzierung auf einem Nanopore-Gerät.
- Basecalling vom Rohsignal zum Nukleotidsequenz.
- Qualitätskontrolle und Filterung.
- Anpassung, Assemblierung, Variante Erkennung oder Metagenom-Klassifizierung.
- Interpretation und Berichterstattung.