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ナノポアシーケンシング

From Nanopore Wiki
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ナノポアシークエンシング

ナノポアシークエンシングは、個々のDNAやRNA分子がナノポアを通過し、その信号の変化をシークエンス情報として解釈できるシークエンシング手法です。

特徴

  • 長いリードでゲノムアセンブリや構造変異の検出に役立つ。
  • リアルタイムのデータ生成と分析。
  • 多くのワークフローで直接DNAやRNAを検出。
  • 携帯可能な機器で、現場や迅速な対応に適している。

一般的なワークフロー

  1. サンプル準備とライブラリ構築。
  2. ナノポアデバイスでのシークエンシング。
  3. 生の信号からヌクレオチドシークエンスへのベースコール。
  4. 品質管理とフィルタリング。
  5. アライメント、アセンブリ、変異検出、またはメタゲノム分類。
  6. 解釈と報告。

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