Séquençage par nanopores
Séquençage par nanopores
Séquençage par nanopores est une approche de séquençage dans laquelle des molécules d'ADN ou d'ARN individuelles passent à travers des nanopores et produisent des changements de signal qui peuvent être interprétés comme des informations de séquence.
Caractéristiques
- Des lectures longues qui peuvent aider à l'assemblage du génome et à la détection des variants structurels.
- Génération et analyse de données en temps réel.
- Sensation directe de l'ADN ou de l'ARN dans de nombreux flux de travail.
- Instruments portables adaptés aux paramètres de terrain et de réponse rapide.
Flux de travail courant
- Préparation de l'échantillon et construction de la bibliothèque.
- Séquençage sur un dispositif à nanopores.
- Conversion des signaux bruts en séquence de nucléotides (basecalling).
- Contrôle qualité et filtrage.
- Alignement, assemblage, appel de variants ou classification métagenomique.
- Interprétation et rapport.