Nanoporen-Sequenzierung
Nanoporen-Sequenzierung
Nanoporen-Sequenzierung ist ein Sequenzierungsverfahren, bei dem einzelne DNS- oder RNA-Moleküle durch Nanoporen passieren und Signaländerungen erzeugen, die als Sequenzinformation interpretiert werden können.
= Merkmale
- Lange Reads, die bei der Genomanalyse und der Detektion struktureller Varianten helfen können.
- Echtzeit-Datenerzeugung und -analyse.
- Direktes DNS- oder RNA-Sensieren in vielen Workflows.
- Portabelle Geräte, die für Einsatz im Feld und bei schnellen Reaktionen geeignet sind.
= Typischer Workflow
- Probenaufbereitung und Bibliothekserschließung.
- Sequenzierung auf einem Nanoporen-Gerät.
- Basecalling vom rohen Signal zur Nukleotidsequenz.
- Qualitätskontrolle und Filterung.
- Ausrichtung, Assemblierung, Variante detection oder Metagenom-Klassifizierung.
- Interpretation und Berichterstattung.