Oxford Nanopore/zh: Difference between revisions
Machine translation from en via nanopore-translate |
Machine translation from en via nanopore-translate |
||
| Line 1: | Line 1: | ||
__NOTOC__ | __NOTOC__ | ||
<div class="mw-translate-fuzzy"> | |||
[[File:Oxford Nanopore MinION side.jpg|thumb|right|320px|Oxford Nanopore MinION portable sequencer. Source: Wikimedia Commons, CC BY-SA 4.0.]] | [[File:Oxford Nanopore MinION side.jpg|thumb|right|320px|Oxford Nanopore MinION portable sequencer. Source: Wikimedia Commons, CC BY-SA 4.0.]] | ||
'''Oxford Nanopore''' 是 Nanopore Wiki 学习路径的一部分。Oxford Nanopore Technologies 开发了纳米孔测序仪器、流动池、化学试剂和软件，用于实时 DNA 和 RNA 测序。 | '''Oxford Nanopore''' 是 Nanopore Wiki 学习路径的一部分。Oxford Nanopore Technologies 开发了纳米孔测序仪器、流动池、化学试剂和软件，用于实时 DNA 和 RNA 测序。 | ||
</div> | |||
== 核心概念 == | == 核心概念 == | ||
| Line 33: | Line 35: | ||
* 结构变异和修饰检测。 | * 结构变异和修饰检测。 | ||
== 常见的陷阱 == | |||
== | * 比较没有化学和模型版本的结果。 | ||
* 忽略读取质量、孔数、运行产量和样本降解。 | |||
* 将研究用途作为未经验证的临床指导。 | |||
* [[ | == 相关页面 == | ||
* [[ | * [[MinION|MinION]] | ||
* [[Nanopore sequencing|Nanopore 测序]] | |||
* [[Bioinformatics|生物信息学]] | * [[Bioinformatics|生物信息学]] | ||
* [[Platforms|平台]] | |||
== 参考文献 == | |||
== | * [https://en.wikipedia.org/wiki/Oxford_Nanopore_Technologies 牛津纳米孔技术公司] | ||
* [https://nanoporetech.com/ 牛津纳米孔技术公司官方网站] | |||
<languages /> | <languages /> | ||
Revision as of 13:36, 30 June 2026
Oxford Nanopore 是 Nanopore Wiki 学习路径的一部分。Oxford Nanopore Technologies 开发了纳米孔测序仪器、流动池、化学试剂和软件，用于实时 DNA 和 RNA 测序。
核心概念
- 该平台读取分子通过纳米孔时产生的电信号。
- 设备家族包括便携式和高吞吐量的仪器。
- 输出可以包括原始信号文件、碱基呼叫读取、比对结果和分析报告。
- 性能取决于化学、流动池质量、文库制备、碱基识别模型和分析设置。
典型的测序工作流程
| 步骤 | 描述 |
|---|---|
| 1 | 根据检测方法准备DNA或RNA文库。 |
| 2 | 将文库加载到流动池上并开始测序。 |
| 3 | 将原始信号转换为序列读取和质量分数。 |
| 4 | 运行质量控制、比对、组装、变异调用、修饰调用或分类。 |
典型应用
- 长读长基因组测序。
- 元基因组学和病原体监测。
- 转录组学和直接RNA测序。
- 结构变异和修饰检测。
常见的陷阱
- 比较没有化学和模型版本的结果。
- 忽略读取质量、孔数、运行产量和样本降解。
- 将研究用途作为未经验证的临床指导。