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'''Bioinformatik''' in der Nanopore-Forschung umfasst die rechnergestützten Schritte, die rohe Nanopore-Signale und -Sequenzen in interpretierbare biologische oder technische Ergebnisse umwandeln. | '''Bioinformatik''' in der Nanopore-Forschung umfasst die rechnergestützten Schritte, die rohe Nanopore-Signale und -Sequenzen in interpretierbare biologische oder technische Ergebnisse umwandeln. | ||
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* Qualitätskontrolle und Filterung der Leseabschnitte. | * Qualitätskontrolle und Filterung der Leseabschnitte. | ||
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* Taxonomische Klassifizierung für Metagenomik und Erregererkennung. | * Taxonomische Klassifizierung für Metagenomik und Erregererkennung. | ||
* Methylierungs- und andere Modifikationsanalysen. | * Methylierungs- und andere Modifikationsanalysen. | ||
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Bioinformatikseiten sollten Toolnamen, Eingabe- und Ausgabeformate, Annahmen, häufige Fehlmodi und Links zu reproduzierbaren Workflows enthalten, soweit verfügbar. | Bioinformatikseiten sollten Toolnamen, Eingabe- und Ausgabeformate, Annahmen, häufige Fehlmodi und Links zu reproduzierbaren Workflows enthalten, soweit verfügbar. | ||
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== Verwandte Seiten == | == Verwandte Seiten == | ||
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* [[Nanopore-Sequenzierung]] | * [[Nanopore-Sequenzierung]] | ||
* [[Glossar]] | * [[Glossar]] | ||
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== References == | |||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Bioinformatics Bioinformatics] | |||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Sequence_alignment Sequence alignment] | |||
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Latest revision as of 09:29, 15 July 2026
Bioinformatik
Bioinformatik in der Nanopore-Forschung umfasst die rechnergestützten Schritte, die rohe Nanopore-Signale und -Sequenzen in interpretierbare biologische oder technische Ergebnisse umwandeln.
Hauptaufgaben
- Basecalling von rohem Signal in Sequenzleseabschnitte.
- Qualitätskontrolle und Filterung der Leseabschnitte.
- Abbildung der Leseabschnitte auf Referenzgenomen.
- De Novo-Genombestimmung.
- Varianteinschätzung und Analyse struktureller Varianten.
- Taxonomische Klassifizierung für Metagenomik und Erregererkennung.
- Methylierungs- und andere Modifikationsanalysen.
Hinweise für diese Wiki-Seite
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