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バイオインフォマティクス

From Nanopore Wiki
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生物情報学

生物情報学はナノポア研究において、生のナノポア信号とリードを解釈可能な生物学的または技術的な結果に変換する計算ステップをカバーしています。

主要なタスク

  • 生信号をシーケンスリードに変換するベースコール。
  • 品質管理とリードのフィルタリング。
  • リファレンスゲノムへのリードマッピング。
  • デノボゲノムアセンブリ。
  • バリエントコールと構造的バリエント解析。
  • メタゲノミクスや病原体検出のための分類学的分類。
  • メチル化その他の修飾解析。

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