数据分析
数据分析 是 Wiki 学习路径的一部分。纳米孔数据分析从原始电流轨迹或测序输出中提取可靠的事件、特征和结论。
核心概念
- 对于感应，原始数据通常是电流-时间曲线。
- 对于测序，数据可能包括 POD5、FAST5、FASTQ、BAM 和报告。
- 分析应保留真实事件特征，同时控制噪声、漂移和伪影。
- 质量控制应在特征提取之前和之后进行。
分析工作流程
| 步骤 | 描述 |
|---|---|
| 1 | 组织元数据和原始文件。 |
| 2 | 评估基线、噪声和漂移。 |
| 3 | 仅使用已记录的参数进行过滤或去趋势。 |
| 4 | 检测事件并提取诸如封锁深度和停留时间等特征。 |
| 5 | 可视化代表性的轨迹和人群统计数据。 |
典型应用
- 单分子传感。
- 测序质量控制。
- 方法比较和故障排除。
常见陷阱
- 仅显示有吸引力的示例轨迹。
- 更改阈值直到出现预期结果。
- 发布没有原始数据来源的功能表。