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Outils et flux de travail

• MinION
• Oxford Nanopore
• Basecalling
• Mise en correspondance de lecture
• Variant calling * Variant calling
• Assemblage du génome * Assemblage du génome
• Contrôle de qualité * Contrôle de qualité

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Applications

• Surveillance de la santé publique
• Génomique clinique et pathogène
• Agriculture et sécurité alimentaire
• Surveillance de l'environnement
• Microbiome et métagénomique
• Analyse des variantes structurelles