Detección de eventos
La detección de eventos forma parte de la ruta de aprendizaje de Nanopore Wiki. La detección de eventos identifica bloqueos reales o cambios en las señales en las grabaciones de nanoporos y extrae características comparables de ellas.
Conceptos básicos
- Los umbrales de detección deben estar relacionados con el ruido de base y el ruido local.
- Los límites del evento afectan las métricas de tiempo de permanencia, área y forma.
- Los eventos débiles, que se superponen o que son de múltiples niveles requieren una validación cuidadosa.
- Los falsos positivos pueden surgir debido al ruido, a la desviación en los datos, a errores en los análisis, a la obstrucción de los sistemas y a las configuraciones incorrectas de los mismos.
Flujo de trabajo de detección de eventos
| Paso | Descripción |
|---|---|
| 1 | Anotar las fases experimentales y los tiempos de adición de muestras. |
| 2 | Estime el valor base local y el ruido (o las perturbaciones no deseadas). |
| 3 | Establezca umbrales para los candidatos y reglas de duración mínima. |
| 4 | Fusionar, dividir o rechazar eventos utilizando criterios documentados. |
| 5 | Exportar tablas y gráficos de eventos para su revisión. |
Aplicaciones típicas
- Cuantificación de la profundidad del bloqueo y el tiempo de permanencia.
- Comparación de muestras o variantes de poros.
- Construcción de datos de entrenamiento para modelos de clasificación.
Peligros comunes
- Usar un umbral único para las grabaciones con una gran desviación (drift).
- No se están probando los casos de falsos positivos en los controles vacíos.
- Tratar la salida automatizada como correcta sin una revisión visual.