平台
平台 是 Nanopore Wiki 学习路径的一部分。Nanopore 平台从定制的单孔电生理装置到商业测序仪器和集成传感芯片不等。
核心概念
- 平台包括孔化学、流动池或腔室、电子设备、软件和耗材。
- 商业系统优先考虑强大的工作流程和吞吐量。
- 自定义装置优先考虑灵活性和机械控制。
- 平台选择决定了文件格式、元数据、控制和分析管道。
平台选择
| 步骤 | 描述 |
|---|---|
| 1 | 定义目标是测序、传感、方法开发还是教学。 |
| 2 | 比较吞吐量、便携性、成本、耗材和所需专业知识。 |
| 3 | 检查数据格式和支持的分析工具。 |
| 4 | 围绕特定平台的故障模式设计控制。 |
典型应用
- 便携式测序。
- 实验室规模的单分子实验。
- 设备工程和传感器开发。
常见陷阱
- 在定义科学问题之前选择仪器。
- 忽略消耗品的可用性、型号版本和软件要求。
- 将营销规范视为实验性保证。