Plattformen
Plattformen ist Teil des Lernpfads von Nanopore Wiki. Nanopore-Plattformen reichen von maßgeschneiderten Einzelpor-Elektrophysiologie-Systemen über kommerzielle Sequenziergeräte bis hin zu integrierten Sensorkarten.
Grundlegende Konzepte
- Eine Plattform umfasst die Porenh Chemie, die Flusszelle bzw. den Reaktorkörper, die Elektronik, die Software sowie die Verbrauchsmaterialien.
- Kommerzielle Systeme legen Wert auf solide Arbeitsabläufe und hohe Durchsatzraten.
- Custom-Rigs legen Wert auf Flexibilität und mechanische Steuerung.
- Die Wahl der Plattform bestimmt die Dateiformate, Metadaten, Steuerungsmöglichkeiten sowie die Analyseverfahren.
Plattformauswahl
| Schritt | Beschreibung |
|---|---|
| 1 | Definieren Sie, ob das Ziel die Abfolgenbildung, die Erkennung von Daten, die Entwicklung von Methoden oder das Lehren ist. |
| 2 | Vergleichen Sie die Durchsatzleistung, die Portabilität, die Kosten, die benötigten Verbrauchsmaterialien sowie das erforderliche Fachwissen. |
| 3 | Überprüfen Sie die Datenformate sowie die unterstützten Analysetools. |
| 4 | Entwerfen Sie Steuermechanismen, die auf plattformspezifische Fehlermuster reagieren. |
Typische Anwendungen
- Portable Sequencing.
- Laboratoriebasierte Experimente mit einzelnen Molekülen.
- Geräteentwicklung und Sensorforschung.
Häufige Fehlerquellen
- Ein Instrument auswählen, bevor die wissenschaftliche Frage definiert wird.
- Die Verfügbarkeit von Verbrauchsmitteln, Modellversionen sowie Softwareanforderungen werden ignoriert.
- Die Behandlung von Marketinganforderungen als experimentelle Garantien.