平台
平台 是 Nanopore Wiki 学习路径的一部分。纳米孔平台范围从定制单孔电生理学装置到商业测序仪器和集成传感芯片。
核心概念
- 平台包括孔化学、流动池或腔室、电子设备、软件和耗材。
- 商业系统优先考虑强大的工作流程和吞吐量。
- 自定义装置优先考虑灵活性和机械控制。
- 平台选择决定了文件格式、元数据、控制和分析管道。
科学依据
- 平台包括孔隙化学、流动池或腔室、电子设备、软件和消耗品。
- 商业系统优先考虑稳健的工作流程和吞吐量。
- 解释应与可测量的数量、实验控制和记录的分析设置相关联。
- 声明应区分直接观察和下游推断。
平台选择
| 步骤 | 说明 |
|---|---|
| 1 | 定义目标是测序、传感、方法开发还是教学。 |
| 2 | 比较吞吐量、便携性、成本、消耗品和所需的专业知识。 |
| 3 | 检查数据格式和支持的分析工具。 |
| 4 | 围绕特定于平台的故障模式设计控制。 |
典型应用
- 便携式测序。
- 实验室规模的单分子实验。
- 设备工程和传感器开发。
质量检查
- 记录平台、孔或流通池类型、化学成分、电压或采集设置以及软件版本。
- 在声明取决于特异性的情况下，使用阴性对照、阳性对照和重复测量。
- 报告噪音、偏差、样品降解、孔隙不稳定性或模型相关分析等限制。
- 不要将供应商规范视为特定于应用程序的验证的替代品。
解释的局限
- 在定义科学问题之前选择仪器。
- 忽略耗材可用性、型号版本和软件要求。
- 单个结果不应推广到超出所使用的样本、协议、仪器状态和分析流程之外。
- 医疗、法律、监管或商业决策需要超出本教育摘要的特定领域验证。