Glossary/zh

Nanopore sequencing and signal terminology are connected across experiment and analysis.

“术语表”（Glossary）是 Nanopore Wiki 学习路径的一部分。该术语表定义了纳米孔技术、测序、信号分析以及实验工作流程中常用的术语。

核心概念

• 开孔电流：通过未占据孔隙的基线电流。
• 封锁深度：指在事件发生期间，信号强度当前减少的程度或信号偏移的幅度。
• 停留时间（Dwell Time）：指分子产生可检测信号（或效应）的持续时间。
• Basecalling：将纳米孔检测得到的原始信号转换为核苷酸序列及其质量值的过程。
• POD5、FAST5、FASTQ 和 BAM：牛津纳米孔（Oxford Nanopore）工作流程中常见的文件格式。

科学依据

• 开孔电流：通过未占据孔隙的基线电流。
• 封锁深度：指在某一事件发生期间，信号强度当前减少的程度或信号偏移的幅度。
• 解释结果应与可测量的数据、实验控制条件以及详细的分析设置相联系。
• 声明应当明确区分直接观察结果与基于这些观察结果得出的推论（即下游推理）。

如何使用此页面

步骤	描述
1	使用定义来确保页面间的用词一致性。
2	请使用以下确切的术语：开孔电流（open-pore current）、阻塞事件（blockade event）以及Q值（Q score）。
3	当某个术语具有特定平台的含义时，必须明确指出该平台。

典型应用

• 新读者的快速参考指南。
• 翻译后的文本：

确保所有翻译后的页面在编辑风格上保持一致。

• 支持课堂和实验室的新员工入职培训（onboarding）。

质量检查

• 记录平台类型、孔径或流式细胞仪的型号、实验所使用的化学试剂、电压设置或数据采集参数，以及所使用的软件版本。
• 在使用负对照（negative controls）、正对照（positive controls）以及重复测量（replicate measurements）时，需要特别关注那些其结论依赖于测量结果精确性的研究或论断。
• 请报告以下问题或限制：噪声、偏差、样本质量下降、孔隙结构不稳定，或分析结果依赖于特定模型（即模型依赖性）等问题。
• 使用相关页面，可以从入门术语逐步过渡到实验性或计算性的详细内容。

解释限制（Interpretation Limits）

• 在未作任何说明的情况下，将“sequencing terms”（测序术语）用于非测序性质的纳米孔实验中。
• 在翻译文件格式或乐器名称时，应确保这些内容保持不变。
• 任何单一的结果都不应被推广到超出所使用的样本、协议、仪器状态以及分析流程的范围之外。
• 医疗、法律、监管或商业方面的决策需要超出本教育性概述范围的、特定领域的验证。

相关页面

• 简介
• 生物信息学（Bioinformatics）
• 数据分析
• 纳米孔测序（Nanopore sequencing）

参考文献

• 牛津纳米孔文件格式（Oxford Nanopore File Formats）
• FASTQ格式