Platforms/es

File:Oxford Nanopore MinION side.jpg

Oxford Nanopore MinION portable sequencer. Source: Wikimedia Commons, CC BY-SA 4.0.

Plataformas forma parte de la ruta de aprendizaje de Nanopore Wiki. Las plataformas Nanopore van desde equipos de electrofisiología de poro único personalizados hasta instrumentos de secuenciación comerciales y chips de detección integrados.

Conceptos básicos

• Una plataforma incluye química de poros, celda o cámara de flujo, electrónica, software y consumibles.
• Los sistemas comerciales dan prioridad a flujos de trabajo robustos y a una alta capacidad de procesamiento (rendimiento).
• Los equipos personalizados priorizan la flexibilidad y el control mecánico.
• La elección de la plataforma determina los formatos de archivo, los metadatos, los controles y los procesos de análisis.

Selección de plataforma

Paso	Descripción
1	Defina si el objetivo es la secuenciación, la detección, el desarrollo de métodos o la enseñanza.
2	Compare el rendimiento, la portabilidad, el costo, los consumibles y la experiencia técnica requerida.
3	Compruebe los formatos de datos y las herramientas de análisis compatibles.
4	Diseñe controles que se adapten a los modos de fallo específicos de cada plataforma.

Aplicaciones típicas

• Secuenciación portátil.
• Experimentos a escala de laboratorio con moléculas individuales.
• Ingeniería de dispositivos y desarrollo de sensores.

Peligros comunes

• Elegir un instrumento antes de definir la pregunta científica.
• Ignorando la disponibilidad de los componentes consumibles, las versiones de los modelos y los requisitos del software.
• Tratar las especificaciones de marketing como garantías experimentales es un enfoque que puede llevar a resultados inesperados o insatisfactorios.

Páginas relacionadas

• Oxford Nanopore
• MinION
• Secuenciación a través de nanoporos
• Flujos de trabajo experimentales

Referencias

• Oxford Nanopore Technologies
• MinION