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[[File:Nanopore_sequencing_principle.png|thumb|right|360px|link=https://www.nanopore.net/index.php?curid=2|Principle of nanopore sequencing. Source: Wikimedia Commons, DBCLS, CC BY 4.0.]] | [[File:Nanopore_sequencing_principle.png|thumb|right|360px|link=https://www.nanopore.net/index.php?curid=2|Principle of nanopore sequencing. Source: Wikimedia Commons, DBCLS, CC BY 4.0.]] | ||
<div style="font-size:188%; line-height:1.2; margin-bottom:0.25em;">ナノポア・ウィキへようこそ</div> | <div style="font-size:188%; line-height:1.2; margin-bottom:0.25em;">ナノポア・ウィキへようこそ</div> | ||
<div style="font-size:108%; max-width:58em;">ナノポア技術、ナノポアシークエンシング、単分子センシング、バイオインフォマティクスのワークフロー、機器、および最先端研究のための知識ベースおよび科学啓発サイト。</div> | <div style="font-size:108%; max-width:58em;">ナノポア技術、ナノポアシークエンシング、単分子センシング、バイオインフォマティクスのワークフロー、機器、および最先端研究のための知識ベースおよび科学啓発サイト。</div> | ||
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ナノポアは、イオンや分子が膜や固体材料を通過できるナノスケールの開口部です。分子がナノポアを通過または近づくと、電流、イオンフロー、または他の測定可能な信号が変化します。これらの信号の変化は、DNA、RNA、タンパク質、小分子、および他の生物学的または化学的システムを単一分子スケールで研究するために使用できます。 | ナノポアは、イオンや分子が膜や固体材料を通過できるナノスケールの開口部です。分子がナノポアを通過または近づくと、電流、イオンフロー、または他の測定可能な信号が変化します。これらの信号の変化は、DNA、RNA、タンパク質、小分子、および他の生物学的または化学的システムを単一分子スケールで研究するために使用できます。 | ||
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Nanopore法が重要であるのは、分子イベントをリアルタイム測定と結びつけることができるからです。配列決定では、長いDNAやRNA分子が孔を通過し、配列情報に変換できる信号を生成します。センシングでは、電流の変化やその他の信号の変化が分子のサイズ、電荷、構造、結合、または化学修飾を示すことができます。 | Nanopore法が重要であるのは、分子イベントをリアルタイム測定と結びつけることができるからです。配列決定では、長いDNAやRNA分子が孔を通過し、配列情報に変換できる信号を生成します。センシングでは、電流の変化やその他の信号の変化が分子のサイズ、電荷、構造、結合、または化学修飾を示すことができます。 | ||
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* [[Bioinformatics|バイオインフォマティクス]] - ベースコール、リードマッピング、アセンブリ、バリエント、および品質管理。 | * [[Bioinformatics|バイオインフォマティクス]] - ベースコール、リードマッピング、アセンブリ、バリエント、および品質管理。 | ||
* [[Glossary|用語集]] - 普段使いの用語の簡潔な定義。 | * [[Glossary|用語集]] - 普段使いの用語の簡潔な定義。 | ||
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== なぜそれが重要なのか == | == なぜそれが重要なのか == | ||
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* 携帯可能な機器は、大規模なシーケンシングセンターの外でもシーケンシングとセンシングを可能にします。 | * 携帯可能な機器は、大規模なシーケンシングセンターの外でもシーケンシングとセンシングを可能にします。 | ||
* 直接的な分子測定は、RNA、塩基修飾、または分子コンテキストに関する情報を保存することができます。 | * 直接的な分子測定は、RNA、塩基修飾、または分子コンテキストに関する情報を保存することができます。 | ||
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* 農業、食品安全、およびバイオセキュリティ | * 農業、食品安全、およびバイオセキュリティ | ||
* 構造変異、ゲノムアセンブリ、RNA解析、およびエピジェネティック修飾検出 | * 構造変異、ゲノムアセンブリ、RNA解析、およびエピジェネティック修飾検出 | ||
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== ツールとワークフロー == | == ツールとワークフロー == | ||
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* リードマッピング、バリアントコール、ゲノムアセンブリ、および品質管理 | * リードマッピング、バリアントコール、ゲノムアセンブリ、および品質管理 | ||
* 実験設計、メタデータ、再現性、および責任ある解釈 | * 実験設計、メタデータ、再現性、および責任ある解釈 | ||
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== 最新の進捗 == | == 最新の進捗 == | ||
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== 寄稿 == | == 寄稿 == | ||
Nanopore Wiki は慎重な貢献を歓迎します: 明確な定義、信頼できる情報源、再現可能な方法、および最近の研究のバランスの取れた要約。新しい進捗項目には、日付、簡潔な説明、および利用可能な情報源を含めるべきです。 | Nanopore Wiki は慎重な貢献を歓迎します: 明確な定義、信頼できる情報源、再現可能な方法、および最近の研究のバランスの取れた要約。新しい進捗項目には、日付、簡潔な説明、および利用可能な情報源を含めるべきです。 | ||
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== サイトノート == | == サイトノート == | ||
Nanopore Wikiは、教育および知識整理のプロジェクトです。そのページは、科学コミュニケーションや一般的な技術的な参照の目的で作成されており、専門的な医療、法律、規制、または商業的な助言に代わるものではありません。 | Nanopore Wikiは、教育および知識整理のプロジェクトです。そのページは、科学コミュニケーションや一般的な技術的な参照の目的で作成されており、専門的な医療、法律、規制、または商業的な助言に代わるものではありません。 | ||
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== 参考文献 == | == 参考文献 == | ||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore ナノポア - Wikipedia] | * [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore ナノポア - Wikipedia] | ||
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* [https://commons.wikimedia.org/wiki/File:202001_nanopore_sequencing.svg ナノポアシークエンシングの原理 - Wikimedia Commons] | * [https://commons.wikimedia.org/wiki/File:202001_nanopore_sequencing.svg ナノポアシークエンシングの原理 - Wikimedia Commons] | ||
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== References == | |||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore Nanopore - Wikipedia] | |||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore_sequencing Nanopore sequencing - Wikipedia] | |||
* [https://commons.wikimedia.org/wiki/File:202001_nanopore_sequencing.svg Principle of nanopore sequencing - Wikimedia Commons] | |||
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Revision as of 13:40, 29 June 2026
ナノポアは、イオンや分子が膜や固体材料を通過できるナノスケールの開口部です。分子がナノポアを通過または近づくと、電流、イオンフロー、または他の測定可能な信号が変化します。これらの信号の変化は、DNA、RNA、タンパク質、小分子、および他の生物学的または化学的システムを単一分子スケールで研究するために使用できます。
Nanopore法が重要であるのは、分子イベントをリアルタイム測定と結びつけることができるからです。配列決定では、長いDNAやRNA分子が孔を通過し、配列情報に変換できる信号を生成します。センシングでは、電流の変化やその他の信号の変化が分子のサイズ、電荷、構造、結合、または化学修飾を示すことができます。
ここから始める
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なぜそれが重要なのか
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アプリケーション
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ツールとワークフロー
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最新の進捗
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寄稿Nanopore Wiki は慎重な貢献を歓迎します: 明確な定義、信頼できる情報源、再現可能な方法、および最近の研究のバランスの取れた要約。新しい進捗項目には、日付、簡潔な説明、および利用可能な情報源を含めるべきです。 サイトノートNanopore Wikiは、教育および知識整理のプロジェクトです。そのページは、科学コミュニケーションや一般的な技術的な参照の目的で作成されており、専門的な医療、法律、規制、または商業的な助言に代わるものではありません。 |
Nanopore Wiki is a knowledge and science-outreach project. The site can host related multilingual, open-content tasks and community-maintained resources:
Concise definitions for nanopore terms.
Research updates, high-level papers, and technology progress.
Workflows for signal, reads, mapping, assembly, and variants.
Portable sequencing devices and practical methods.
How to read, search, and contribute.
Quality standards for rigorous writing and sourcing.