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<div style="border:1px solid #a2a9b1; background:#f8f9fa; padding:1.2em; margin-bottom:1em; overflow:hidden;">
[[File:Nanopore_sequencing_principle.png|thumb|right|360px|Principle of nanopore sequencing. Source: Wikimedia Commons, DBCLS, CC BY 4.0.]]
[[File:Nanopore_sequencing_principle.png|thumb|right|360px|link=https://www.nanopore.net/index.php?curid=2|Principe du s?quen?age par nanopores. Source : Wikimedia Commons, DBCLS, CC BY 4.0.]]
<div style="font-size:188%; line-height:1.2; margin-bottom:0.25em;">Bienvenue sur le Wiki Nanopore</div>
<div style="font-size:188%; line-height:1.2; margin-bottom:0.25em;">Bienvenue sur Nanopore Wiki</div>
Une base de connaissances et un site de vulgarisation scientifique pour la technologie nanopore, le séquençage nanopore, la détection de molécules uniques, les flux de travail bioinformatiques, les instruments et la recherche exploratoire </div>_.
<div style="font-size:108%; max-width:58em;">Une base de connaissances et un site de vulgarisation scientifique consacr?s ? la technologie des nanopores, au s?quen?age par nanopores, ? la d?tection de mol?cules uniques, aux flux de travail bioinformatiques, aux instruments et aux recherches de pointe.</div>
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Les nanopores sont des ouvertures ? l??chelle nanom?trique qui permettent ? des ions ou ? des mol?cules de traverser une membrane ou un mat?riau solide. Lorsqu?une mol?cule traverse un nanopore ou s?en approche, elle peut modifier un courant ?lectrique, un flux ionique ou un autre signal mesurable. Ces variations de signal peuvent ?tre utilis?es pour ?tudier l?ADN, l?ARN, les prot?ines, les petites mol?cules et d?autres syst?mes biologiques ou chimiques ? l??chelle de la mol?cule unique.
Les m?thodes ? nanopores sont importantes parce qu?elles relient des ?v?nements mol?culaires ? des mesures en temps r?el. En s?quen?age, de longues mol?cules d?ADN ou d?ARN traversent un pore et produisent des signaux qui peuvent ?tre convertis en informations de s?quence. En d?tection, les changements de courant ou d?autres signaux peuvent r?v?ler la taille, la charge, la structure, la liaison ou la modification chimique d?une mol?cule.


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== Commencer ici ==
== Commencer ici ==
* [[Nanopore technology|Technologie des nanopores]]
* [[Nanopore technology|Technologie des nanopores]] - principes, types de pores, signaux et concepts de mesure.
* [[Nanopore sequencing|Séquençage nanopore]]
* [[Nanopore sequencing|S?quen?age par nanopores]] - fonctionnement du s?quen?age de l?ADN et de l?ARN par nanopores.
* [[Single-molecule detection|Détection d'une seule molécule]] * [[Single-molecule detection|Détection d'une seule molécule]]
* [[Single-molecule detection|D?tection de mol?cule unique]] - comment les nanopores peuvent d?tecter des mol?cules individuelles.
* [[Bioinformatics|Bioinformatics]]
* [[Bioinformatics|Bioinformatique]] - basecalling, alignement des lectures, assemblage, variants et contr?le qualit?.
* [[Glossary|Glossaire]]
* [[Glossary|Glossaire]] - d?finitions concises des termes courants.


Les nanopores sont des pores à l'échelle nanométrique qui peuvent être utilisés pour observer les molécules par le biais de changements dans le courant électrique, le flux d'ions ou d'autres signaux mesurables. Ils sont donc utiles pour le séquençage, la détection moléculaire et l'analyse en temps réel.
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== Pourquoi c?est important ==
* Les lectures longues peuvent couvrir des r?p?titions, des variants structuraux et des r?gions g?nomiques complexes.
* L?analyse en temps r?el peut soutenir des d?cisions rapides sur le terrain, en clinique et au laboratoire.
* Les instruments portables rendent le s?quen?age et la d?tection possibles hors des grands centres de s?quen?age.
* Les mesures mol?culaires directes peuvent pr?server des informations sur l?ARN, les modifications de bases ou le contexte mol?culaire.


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== Derniers progrès ==
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== Sujets de recherche ==
== Applications ==
* [[Long-read sequencing|Séquençage à lecture longue]]
* Surveillance de la sant? publique et g?nomique des agents pathog?nes
* [[Direct RNA sequencing|Séquençage direct de l'ARN]] * [[Direct RNA sequencing|Séquençage direct de l'ARN]]
* Recherche clinique et sur les maladies infectieuses
* [[Epigenetic modification detection|Détection des modifications épigénétiques]] * [[Epigenetic modification detection|Détection des modifications épigénétiques]]
* ADN environnemental et suivi de la biodiversit?
* [[Pathogen detection|Détection de pathogènes]]
* Analyse du microbiome et m?tag?nomique
* [[Environmental DNA|ADN environnemental]] * [[Environmental DNA|ADN environnemental]]
* Agriculture, s?curit? alimentaire et bios?curit?
* [[Protein nanopore sensing|Détection par nanopores de protéines]] * [[Protein nanopore sensing|Détection par nanopores de protéines]]
* Variation structurale, assemblage de g?nomes, analyse de l?ARN et d?tection des modifications ?pig?n?tiques


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== Outils et flux de travail ==
== Outils et flux de travail ==
* [[MinION|MinION]]
* [[MinION]] et autres instruments portables de s?quen?age
* [[Oxford Nanopore|Oxford Nanopore]]
* Plateformes [[Oxford Nanopore]] et concepts de chimie de s?quen?age
* [[Basecalling|Basecalling]]
* Basecalling du signal brut vers les lectures de s?quence
* [[Read mapping|Mise en correspondance de lecture]]
* Alignement des lectures, appel de variants, assemblage de g?nomes et contr?le qualit?
* [[Variant calling|Variant calling]] * [[Variant calling|Variant calling]]
* Conception exp?rimentale, m?tadonn?es, reproductibilit? et interpr?tation responsable
* [[Genome assembly|Assemblage du génome]] * [[Genome assembly|Assemblage du génome]]
 
* [[Quality control|Contrôle de qualité]] * [[Quality control|Contrôle de qualité]]
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== Applications ==
== Derni?res avanc?es ==
* Surveillance de la santé publique
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* Génomique clinique et pathogène
* Agriculture et sécurité alimentaire
* Surveillance de l'environnement
* Microbiome et métagénomique
* Analyse des variantes structurelles


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== Contribuer ==
== Contribuer ==
Ajoutez de nouvelles pages, améliorez les définitions, résumez les articles récents et tenez les pages sur les méthodes à jour. Pour les nouveaux progrès, éditez [[Latest Progress|Derniers progrès]] pour que la page d'accueil soit mise à jour automatiquement.
Nanopore Wiki accueille les contributions rigoureuses : d?finitions claires, sources fiables, m?thodes reproductibles et r?sum?s ?quilibr?s des recherches r?centes. Les nouvelles informations de progr?s doivent inclure une date, une explication concise et une source lorsqu?elle est disponible.
 
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Nanopore Wiki est un projet ?ducatif et d?organisation des connaissances. Ses pages sont destin?es ? la communication scientifique et ? la r?f?rence technique g?n?rale, et ne remplacent pas un avis professionnel m?dical, juridique, r?glementaire ou commercial.


== Références ==
== R?f?rences ==
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore Nanopore - Wikipedia]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore Nanopore - Wikipedia]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore_sequencing Séquençage par nanopore - Wikipedia]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore_sequencing Nanopore sequencing - Wikipedia]
* [https://commons.wikimedia.org/wiki/File:202001_nanopore_sequencing.svg Principe du séquençage par nanopore - Wikimedia Commons]
* [https://commons.wikimedia.org/wiki/File:202001_nanopore_sequencing.svg Principe du s?quen?age par nanopores - Wikimedia Commons]
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Revision as of 12:59, 29 June 2026

Principe du s?quen?age par nanopores. Source : Wikimedia Commons, DBCLS, CC BY 4.0.
Bienvenue sur Nanopore Wiki
Une base de connaissances et un site de vulgarisation scientifique consacr?s ? la technologie des nanopores, au s?quen?age par nanopores, ? la d?tection de mol?cules uniques, aux flux de travail bioinformatiques, aux instruments et aux recherches de pointe.

Les nanopores sont des ouvertures ? l??chelle nanom?trique qui permettent ? des ions ou ? des mol?cules de traverser une membrane ou un mat?riau solide. Lorsqu?une mol?cule traverse un nanopore ou s?en approche, elle peut modifier un courant ?lectrique, un flux ionique ou un autre signal mesurable. Ces variations de signal peuvent ?tre utilis?es pour ?tudier l?ADN, l?ARN, les prot?ines, les petites mol?cules et d?autres syst?mes biologiques ou chimiques ? l??chelle de la mol?cule unique.

Les m?thodes ? nanopores sont importantes parce qu?elles relient des ?v?nements mol?culaires ? des mesures en temps r?el. En s?quen?age, de longues mol?cules d?ADN ou d?ARN traversent un pore et produisent des signaux qui peuvent ?tre convertis en informations de s?quence. En d?tection, les changements de courant ou d?autres signaux peuvent r?v?ler la taille, la charge, la structure, la liaison ou la modification chimique d?une mol?cule.

Commencer ici

Pourquoi c?est important

  • Les lectures longues peuvent couvrir des r?p?titions, des variants structuraux et des r?gions g?nomiques complexes.
  • L?analyse en temps r?el peut soutenir des d?cisions rapides sur le terrain, en clinique et au laboratoire.
  • Les instruments portables rendent le s?quen?age et la d?tection possibles hors des grands centres de s?quen?age.
  • Les mesures mol?culaires directes peuvent pr?server des informations sur l?ARN, les modifications de bases ou le contexte mol?culaire.

Applications

  • Surveillance de la sant? publique et g?nomique des agents pathog?nes
  • Recherche clinique et sur les maladies infectieuses
  • ADN environnemental et suivi de la biodiversit?
  • Analyse du microbiome et m?tag?nomique
  • Agriculture, s?curit? alimentaire et bios?curit?
  • Variation structurale, assemblage de g?nomes, analyse de l?ARN et d?tection des modifications ?pig?n?tiques

Outils et flux de travail

  • MinION et autres instruments portables de s?quen?age
  • Plateformes Oxford Nanopore et concepts de chimie de s?quen?age
  • Basecalling du signal brut vers les lectures de s?quence
  • Alignement des lectures, appel de variants, assemblage de g?nomes et contr?le qualit?
  • Conception exp?rimentale, m?tadonn?es, reproductibilit? et interpr?tation responsable

Derni?res avanc?es

  • 2026-06-27 - La page d?accueil de Nanopore Wiki a ?t? lanc?e avec une mise en page de portail pour suivre la technologie des nanopores, le s?quen?age, les outils et les progr?s de la recherche.

Contribuer

Nanopore Wiki accueille les contributions rigoureuses : d?finitions claires, sources fiables, m?thodes reproductibles et r?sum?s ?quilibr?s des recherches r?centes. Les nouvelles informations de progr?s doivent inclure une date, une explication concise et une source lorsqu?elle est disponible.

Notes sur le site

Nanopore Wiki est un projet ?ducatif et d?organisation des connaissances. Ses pages sont destin?es ? la communication scientifique et ? la r?f?rence technique g?n?rale, et ne remplacent pas un avis professionnel m?dical, juridique, r?glementaire ou commercial.

R?f?rences

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