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[[File:Nanopore_sequencing_principle.png|thumb|right|360px|Principle of nanopore sequencing. Source: Wikimedia Commons, DBCLS, CC BY 4.0.]]
[[File:Nanopore_sequencing_principle.png|thumb|right|360px|link=https://www.nanopore.net/index.php?curid=2|Prinzip der Nanoporen-Sequenzierung. Quelle: Wikimedia Commons, DBCLS, CC BY 4.0.]]
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<div style="font-size:188%; line-height:1.2; margin-bottom:0.25em;">Willkommen bei Nanopore Wiki</div>
<div style="font-size:108%; max-width:58em;">Eine Wissensbasis und wissenschaftliche Website für Nanopore-Technologie, Nanopore-Sequenzierung, Einzelmolekül-Sensorik, Bioinformatik-Workflows, Instrumente und Pionierforschung </div>
<div style="font-size:108%; max-width:58em;">Eine Wissensdatenbank und Wissenschaftsseite zu Nanoporentechnologie, Nanoporen-Sequenzierung, Einzelmolek?l-Sensorik, bioinformatischen Arbeitsabl?ufen, Instrumenten und aktueller Forschung.</div>
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Nanoporen sind ?ffnungen im Nanometerma?stab, durch die Ionen oder Molek?le eine Membran oder ein Festk?rpermaterial passieren k?nnen. Wenn sich ein Molek?l durch eine Nanopore bewegt oder ihr nahekommt, kann es einen elektrischen Strom, einen Ionenfluss oder ein anderes messbares Signal ver?ndern. Solche Signal?nderungen lassen sich nutzen, um DNA, RNA, Proteine, kleine Molek?le und andere biologische oder chemische Systeme auf Einzelmolek?lebene zu untersuchen.
Nanoporenmethoden sind wichtig, weil sie molekulare Ereignisse mit Echtzeitmessungen verbinden k?nnen. Bei der Sequenzierung passieren lange DNA- oder RNA-Molek?le eine Pore und erzeugen Signale, die in Sequenzinformationen umgewandelt werden k?nnen. In der Sensorik k?nnen ?nderungen des Stroms oder anderer Signale Hinweise auf Gr??e, Ladung, Struktur, Bindung oder chemische Modifikation eines Molek?ls geben.


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== Start Here ==
== Einstieg ==
* [[Nanopore technology|Nanoporentechnik]]
* [[Nanopore technology|Nanoporentechnologie]] - Prinzipien, Porentypen, Signale und Messkonzepte.
* [[Nanopore sequencing|Nanoporen-Sequenzierung]]
* [[Nanopore sequencing|Nanoporen-Sequenzierung]] - wie DNA- und RNA-Sequenzierung mit Nanoporen funktioniert.
* [[Single-molecule detection|Einzelmoleküldetektion]]
* [[Single-molecule detection|Einzelmolek?l-Detektion]] - wie Nanoporen einzelne Molek?le erkennen k?nnen.
* [[Bioinformatics|Bioinformatics]]
* [[Bioinformatics|Bioinformatik]] - Basecalling, Read-Mapping, Assemblierung, Varianten und Qualit?tskontrolle.
* [[Glossary|Glossar]]
* [[Glossary|Glossar]] - kurze Definitionen h?ufig verwendeter Begriffe.


Nanoporen sind nanoskalige Poren, die zur Beobachtung von Molekülen durch Veränderungen des elektrischen Stroms, des Ionenflusses oder anderer messbarer Signale verwendet werden können. Dies macht sie nützlich für die Sequenzierung, molekulare Sensorik und Echtzeitanalyse.
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== Warum es wichtig ist ==
* Lange Reads k?nnen Wiederholungen, strukturelle Varianten und komplexe Genomregionen ?berbr?cken.
* Echtzeitanalysen k?nnen schnelle Entscheidungen im Feld, in der Klinik und im Labor unterst?tzen.
* Tragbare Instrumente erm?glichen Sequenzierung und Sensorik au?erhalb gro?er Sequenzierzentren.
* Direkte molekulare Messungen k?nnen Informationen ?ber RNA, Basenmodifikationen oder molekularen Kontext erhalten.


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== Letzter Fortschritt ==
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== Forschungsthemen ==
== Anwendungen ==
* [[Long-read sequencing|Long-read Sequenzierung]]
* ?berwachung der ?ffentlichen Gesundheit und Pathogen-Genomik
* [[Direct RNA sequencing|Direkte RNA-Sequenzierung]]
* Klinische Forschung und Forschung zu Infektionskrankheiten
* [[Epigenetic modification detection|Epigenetische Modifikationsdetektion]]
* Umwelt-DNA und Biodiversit?tsmonitoring
* [[Pathogen detection|Erregernachweis]]
* Mikrobiom- und Metagenomanalyse
* [[Environmental DNA|Umgebungs-DNA]]
* Landwirtschaft, Lebensmittelsicherheit und Biosicherheit
* [[Protein nanopore sensing|Protein-Nanoporen-Sensing]]
* Strukturelle Variation, Genomassemblierung, RNA-Analyse und Nachweis epigenetischer Modifikationen


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== Tools und Workflows ==
== Werkzeuge und Arbeitsabl?ufe ==
* [[MinION|MinION]]
* [[MinION]] und andere tragbare Sequenzierinstrumente
* [[Oxford Nanopore|Oxford Nanopore]]
* [[Oxford Nanopore]]-Plattformen und Konzepte der Sequenzierchemie
* [[Basecalling|Basecalling]]
* Basecalling vom Rohsignal zu Sequenz-Reads
* [[Read mapping|Read mapping]]
* Read-Mapping, Variant Calling, Genomassemblierung und Qualit?tskontrolle
* [[Variant calling|Variantenaufruf]]
* Versuchsdesign, Metadaten, Reproduzierbarkeit und verantwortungsvolle Interpretation
* [[Genome assembly|Genomzusammenbau]]
 
* [[Quality control|Qualitätskontrolle]]
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== Anwendungen ==
== Neueste Fortschritte ==
* Überwachung der öffentlichen Gesundheit
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* Klinische und Erregergenomik
* Landwirtschaft und Lebensmittelsicherheit
* Umweltüberwachung
* Mikrobiom und Metagenomik
* Strukturelle Variantenanalyse


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== Mitwirken ==
Fügen Sie neue Seiten hinzu, verbessern Sie Definitionen, fassen Sie neue Arbeiten zusammen und halten Sie die Methodenseiten auf dem neuesten Stand. Bei neuen Fortschritten editieren Sie [[Latest Progress|Letzte Fortschritte]], damit die Homepage automatisch aktualisiert wird.
Nanopore Wiki begr??t sorgf?ltige Beitr?ge: klare Definitionen, zuverl?ssige Quellen, reproduzierbare Methoden und ausgewogene Zusammenfassungen aktueller Forschung. Neue Fortschrittsmeldungen sollten ein Datum, eine knappe Erkl?rung und, wenn verf?gbar, eine Quelle enthalten.
 
== Hinweise zur Website ==
Nanopore Wiki ist ein Bildungs- und Wissensorganisationsprojekt. Die Seiten dienen der Wissenschaftskommunikation und allgemeinen technischen Orientierung und ersetzen keine professionelle medizinische, rechtliche, regulatorische oder gesch?ftliche Beratung.


== Referenzen ==
== Literatur und Quellen ==
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore Nanopore - Wikipedia]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore Nanopore - Wikipedia]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore_sequencing Nanoporen-Sequenzierung - Wikipedia]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore_sequencing Nanopore sequencing - Wikipedia]
* [https://commons.wikimedia.org/wiki/File:202001_nanopore_sequencing.svg Prinzip der Nanoporen-Sequenzierung - Wikimedia Commons]
* [https://commons.wikimedia.org/wiki/File:202001_nanopore_sequencing.svg Prinzip der Nanoporen-Sequenzierung - Wikimedia Commons]
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Revision as of 12:58, 29 June 2026

Prinzip der Nanoporen-Sequenzierung. Quelle: Wikimedia Commons, DBCLS, CC BY 4.0.
Willkommen bei Nanopore Wiki
Eine Wissensdatenbank und Wissenschaftsseite zu Nanoporentechnologie, Nanoporen-Sequenzierung, Einzelmolek?l-Sensorik, bioinformatischen Arbeitsabl?ufen, Instrumenten und aktueller Forschung.

Nanoporen sind ?ffnungen im Nanometerma?stab, durch die Ionen oder Molek?le eine Membran oder ein Festk?rpermaterial passieren k?nnen. Wenn sich ein Molek?l durch eine Nanopore bewegt oder ihr nahekommt, kann es einen elektrischen Strom, einen Ionenfluss oder ein anderes messbares Signal ver?ndern. Solche Signal?nderungen lassen sich nutzen, um DNA, RNA, Proteine, kleine Molek?le und andere biologische oder chemische Systeme auf Einzelmolek?lebene zu untersuchen.

Nanoporenmethoden sind wichtig, weil sie molekulare Ereignisse mit Echtzeitmessungen verbinden k?nnen. Bei der Sequenzierung passieren lange DNA- oder RNA-Molek?le eine Pore und erzeugen Signale, die in Sequenzinformationen umgewandelt werden k?nnen. In der Sensorik k?nnen ?nderungen des Stroms oder anderer Signale Hinweise auf Gr??e, Ladung, Struktur, Bindung oder chemische Modifikation eines Molek?ls geben.

Einstieg

Warum es wichtig ist

  • Lange Reads k?nnen Wiederholungen, strukturelle Varianten und komplexe Genomregionen ?berbr?cken.
  • Echtzeitanalysen k?nnen schnelle Entscheidungen im Feld, in der Klinik und im Labor unterst?tzen.
  • Tragbare Instrumente erm?glichen Sequenzierung und Sensorik au?erhalb gro?er Sequenzierzentren.
  • Direkte molekulare Messungen k?nnen Informationen ?ber RNA, Basenmodifikationen oder molekularen Kontext erhalten.

Anwendungen

  • ?berwachung der ?ffentlichen Gesundheit und Pathogen-Genomik
  • Klinische Forschung und Forschung zu Infektionskrankheiten
  • Umwelt-DNA und Biodiversit?tsmonitoring
  • Mikrobiom- und Metagenomanalyse
  • Landwirtschaft, Lebensmittelsicherheit und Biosicherheit
  • Strukturelle Variation, Genomassemblierung, RNA-Analyse und Nachweis epigenetischer Modifikationen

Werkzeuge und Arbeitsabl?ufe

  • MinION und andere tragbare Sequenzierinstrumente
  • Oxford Nanopore-Plattformen und Konzepte der Sequenzierchemie
  • Basecalling vom Rohsignal zu Sequenz-Reads
  • Read-Mapping, Variant Calling, Genomassemblierung und Qualit?tskontrolle
  • Versuchsdesign, Metadaten, Reproduzierbarkeit und verantwortungsvolle Interpretation

Neueste Fortschritte

  • 2026-06-27 - Die Startseite von Nanopore Wiki wurde mit einem Portal-Layout ver?ffentlicht, um Nanoporentechnologie, Sequenzierung, Werkzeuge und Forschungsfortschritte zu verfolgen.



Mitwirken

Nanopore Wiki begr??t sorgf?ltige Beitr?ge: klare Definitionen, zuverl?ssige Quellen, reproduzierbare Methoden und ausgewogene Zusammenfassungen aktueller Forschung. Neue Fortschrittsmeldungen sollten ein Datum, eine knappe Erkl?rung und, wenn verf?gbar, eine Quelle enthalten.

Hinweise zur Website

Nanopore Wiki ist ein Bildungs- und Wissensorganisationsprojekt. Die Seiten dienen der Wissenschaftskommunikation und allgemeinen technischen Orientierung und ersetzen keine professionelle medizinische, rechtliche, regulatorische oder gesch?ftliche Beratung.

Literatur und Quellen