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== Einstieg ==
== Hier anfangen ==
* [[Nanopore technology|Nanoporentechnologie]] - Prinzipien, Porentypen, Signale und Messkonzepte.
* [[Nanopore technology|Nanopore-Technologie]] - Prinzipien, Porenarten, Signale und Messkonzepte.
* [[Nanopore sequencing|Nanoporen-Sequenzierung]] - wie DNA- und RNA-Sequenzierung mit Nanoporen funktioniert.
* [[Nanopore sequencing|Nanopore-Sequenzierung]] - Wie die DNA- und RNA-Sequenzierung mit Nanoporen funktioniert.
* [[Single-molecule detection|Einzelmolek?l-Detektion]] - wie Nanoporen einzelne Molek?le erkennen k?nnen.
* [[Single-molecule detection|Einzel-Molekül-Erkennung]] - wie Nanoporen einzelne Moleküle erkennen können.
* [[Bioinformatics|Bioinformatik]] - Basecalling, Read-Mapping, Assemblierung, Varianten und Qualit?tskontrolle.
* [[Bioinformatics|Bioinformatik]] - Basecalling, Read Mapping, Assembly, Varianten und Qualitätskontrolle.
* [[Glossary|Glossar]] - kurze Definitionen h?ufig verwendeter Begriffe.
* [[Glossary|Glossar]] - prägnante Definitionen gebräuchlicher Begriffe.


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== Warum es wichtig ist ==
== Warum es wichtig ist ==
* Lange Reads k?nnen Wiederholungen, strukturelle Varianten und komplexe Genomregionen ?berbr?cken.
* Lange Reads können Wiederholungen, strukturelle Varianten und komplexe genomische Regionen umfassen.
* Echtzeitanalysen k?nnen schnelle Entscheidungen im Feld, in der Klinik und im Labor unterst?tzen.
* Echtzeitanalyse kann schnelle Entscheidungen in Feld-, klinischen und laboratorischen Einstellungen unterstützen.
* Tragbare Instrumente erm?glichen Sequenzierung und Sensorik au?erhalb gro?er Sequenzierzentren.
* Portable Geräte ermöglichen die Sequenzierung und Sensierung außerhalb großer Sequenzierungszentren.
* Direkte molekulare Messungen k?nnen Informationen ?ber RNA, Basenmodifikationen oder molekularen Kontext erhalten.
* Direkte molekulare Messungen können Informationen über RNA, Basenmodifikationen oder molekularen Kontext erhalten.


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== Anwendungen ==
== Anwendungen ==
* ?berwachung der ?ffentlichen Gesundheit und Pathogen-Genomik
* Öffentliche Gesundheitssurveillance und Pathogen-Genomik
* Klinische Forschung und Forschung zu Infektionskrankheiten
* Klinische und Infektionskrankheitsforschung
* Umwelt-DNA und Biodiversit?tsmonitoring
* Umwelt-DNA und Biodiversitätsüberwachung
* Mikrobiom- und Metagenomanalyse
* Mikrobiom und Metagenom-Analyse
* Landwirtschaft, Lebensmittelsicherheit und Biosicherheit
* Landwirtschaft, Lebensmittelsicherheit und Biosicherheit
* Strukturelle Variation, Genomassemblierung, RNA-Analyse und Nachweis epigenetischer Modifikationen
* Strukturelle Variation, Genomanalyse, RNA-Analyse und Detektion epigenetischer Modifikationen


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== Werkzeuge und Arbeitsabl?ufe ==
== Werkzeuge und Workflows ==
* [[MinION]] und andere tragbare Sequenzierinstrumente
* [[MinION|MinION]] und andere portable Sequenziergeräte
* [[Oxford Nanopore]]-Plattformen und Konzepte der Sequenzierchemie
* [[Oxford Nanopore|Oxford Nanopore]] Plattformen und chemische Konzepte
* Basecalling vom Rohsignal zu Sequenz-Reads
* Basecalling von Rohsignal zu Sequenzlektüren
* Read-Mapping, Variant Calling, Genomassemblierung und Qualit?tskontrolle
* Leseabbildung, Variante detection, Genomanalyse und Qualitätskontrolle
* Versuchsdesign, Metadaten, Reproduzierbarkeit und verantwortungsvolle Interpretation
* Versuchsplanung, Metadaten, Reproduzierbarkeit und verantwortungsvolle Interpretation


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== Mitwirken ==
== Beitragen ==
Nanopore Wiki begr??t sorgf?ltige Beitr?ge: klare Definitionen, zuverl?ssige Quellen, reproduzierbare Methoden und ausgewogene Zusammenfassungen aktueller Forschung. Neue Fortschrittsmeldungen sollten ein Datum, eine knappe Erkl?rung und, wenn verf?gbar, eine Quelle enthalten.
Nanopore Wiki begrüßt sorgfältige Beiträge: klare Definitionen, verlässliche Quellen, nachvollziehbare Methoden und ausgewogene Zusammenfassungen aktueller Forschung. Neue Fortschrittsmeldungen sollten ein Datum, eine prägnante Erklärung und eine Quelle, soweit verfügbar, enthalten.


== Hinweise zur Website ==
== Site Notes
Nanopore Wiki ist ein Bildungs- und Wissensorganisationsprojekt. Die Seiten dienen der Wissenschaftskommunikation und allgemeinen technischen Orientierung und ersetzen keine professionelle medizinische, rechtliche, regulatorische oder gesch?ftliche Beratung.


== Literatur und Quellen ==
(Note: The term "Site Notes" is often used in English for specific sections or pages. If there is a more common German term or phrase used in the context of MediaWiki, please provide it for a more accurate translation.)
 
Seitennotizen ==
Nanopore Wiki ist ein bildungs- und wissensorganisatorisches Projekt. Seine Seiten dienen der Wissenschaftskommunikation und allgemeinen technischen Referenz und ersetzen keinen professionellen medizinischen, rechtlichen, regulatorischen oder kommerziellen Rat.
 
== Referenzen ==
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore Nanopore - Wikipedia]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore Nanopore - Wikipedia]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore_sequencing Nanopore sequencing - Wikipedia]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Nanopore_sequencing Nanopore-Sequenzierung - Wikipedia]
* [https://commons.wikimedia.org/wiki/File:202001_nanopore_sequencing.svg Prinzip der Nanoporen-Sequenzierung - Wikimedia Commons]
* [https://commons.wikimedia.org/wiki/File:202001_nanopore_sequencing.svg Prinzip der Nanopore-Sequenzierung - Wikimedia Commons]
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Revision as of 13:15, 29 June 2026

Principle of nanopore sequencing. Source: Wikimedia Commons, DBCLS, CC BY 4.0.
Willkommen bei Nanopore Wiki
Eine Wissensdatenbank und ein Wissenschaftsausstiegssite für Nanopore-Technologie, Nanopore-Sequenzierung, Single-Molecule-Sensing, Bioinformatik-Workflows, Instrumente und Grenzgebietsforschung.

Nanoporen sind nanoskalige Öffnungen, die es Ionen oder Molekülen ermöglichen, durch eine Membran oder ein feststoffbasiertes Material zu passieren. Wenn ein Molekül durch oder in der Nähe eines Nanoporen bewegt wird, kann es einen elektrischen Strom, Ionenfluss oder ein anderes messbares Signal verändern. Diese Signaländerungen können verwendet werden, um DNA, RNA, Proteine, kleine Moleküle und andere biologische oder chemische Systeme auf der Einzelmolekülebene zu untersuchen.

Nanopore-Methoden sind wichtig, weil sie molekulare Ereignisse mit Echtzeitmessungen verbinden können. Beim Sequenzieren passieren lange DNS- oder RNA-Moleküle ein Pore und erzeugen Signale, die in Sequenzinformation umgewandelt werden können. Beim Sensieren können Änderungen des Stroms oder anderer Signale die molekulare Größe, Ladung, Struktur, Bindung oder chemische Modifikation offenbaren.

Hier anfangen

Warum es wichtig ist

  • Lange Reads können Wiederholungen, strukturelle Varianten und komplexe genomische Regionen umfassen.
  • Echtzeitanalyse kann schnelle Entscheidungen in Feld-, klinischen und laboratorischen Einstellungen unterstützen.
  • Portable Geräte ermöglichen die Sequenzierung und Sensierung außerhalb großer Sequenzierungszentren.
  • Direkte molekulare Messungen können Informationen über RNA, Basenmodifikationen oder molekularen Kontext erhalten.

Anwendungen

  • Öffentliche Gesundheitssurveillance und Pathogen-Genomik
  • Klinische und Infektionskrankheitsforschung
  • Umwelt-DNA und Biodiversitätsüberwachung
  • Mikrobiom und Metagenom-Analyse
  • Landwirtschaft, Lebensmittelsicherheit und Biosicherheit
  • Strukturelle Variation, Genomanalyse, RNA-Analyse und Detektion epigenetischer Modifikationen

Werkzeuge und Workflows

  • MinION und andere portable Sequenziergeräte
  • Oxford Nanopore Plattformen und chemische Konzepte
  • Basecalling von Rohsignal zu Sequenzlektüren
  • Leseabbildung, Variante detection, Genomanalyse und Qualitätskontrolle
  • Versuchsplanung, Metadaten, Reproduzierbarkeit und verantwortungsvolle Interpretation

Neueste Fortschritte

  • 2026-06-27 - Die Startseite von Nanopore Wiki wurde mit einem Portal-Layout ver?ffentlicht, um Nanoporentechnologie, Sequenzierung, Werkzeuge und Forschungsfortschritte zu verfolgen.



Beitragen

Nanopore Wiki begrüßt sorgfältige Beiträge: klare Definitionen, verlässliche Quellen, nachvollziehbare Methoden und ausgewogene Zusammenfassungen aktueller Forschung. Neue Fortschrittsmeldungen sollten ein Datum, eine prägnante Erklärung und eine Quelle, soweit verfügbar, enthalten.

== Site Notes

(Note: The term "Site Notes" is often used in English for specific sections or pages. If there is a more common German term or phrase used in the context of MediaWiki, please provide it for a more accurate translation.)

Seitennotizen == Nanopore Wiki ist ein bildungs- und wissensorganisatorisches Projekt. Seine Seiten dienen der Wissenschaftskommunikation und allgemeinen technischen Referenz und ersetzen keinen professionellen medizinischen, rechtlichen, regulatorischen oder kommerziellen Rat.

Referenzen