Latest revision as of 09:30, 15 July 2026

用語集

この用語集では、Nanopore Wiki 全体で使用される短い定義をまとめています。

ベースコール: ナノポア信号データをヌクレオチド配列リードに変換すること。

ロングリード: 典型的なショートリードシーケンシングの出力よりもはるかに長いシーケンシングリードで、アセンブリや構造変異検出にしばしば有用です。

ナノポア: 電流、イオンフロー、またはその他の測定可能な信号の変化を用いて分子を検出するナノスケールの孔。

リードマッピング: シーケンシングリードをリファレンスゲノムやリファレンスシーケンスにアラインすること。

単分子センシング: 一括平均だけでなく、個々の分子を検出または測定すること。

構造変異: 挿入、欠失、重複、転座、転位などの、より大きな DNA 配列に影響を与えるゲノムの変化。

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-この用語集では、Nanopore Wiki で使用される短い定義をまとめています。
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+この用語集では、Nanopore Wiki 全体で使用される短い定義をまとめています。
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 ; ベースコール
 : ナノポア信号データをヌクレオチド配列リードに変換すること。
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 ; ロングリード
-: 典型的なショートリードシーケンシングの出力よりもはるかに長いシーケンシングリードで、アセンブリや構造変異の検出にしばしば有用です。
+: 典型的なショートリードシーケンシングの出力よりもはるかに長いシーケンシングリードで、アセンブリや構造変異検出にしばしば有用です。
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 ; ナノポア
-: 電流、イオンフロー、またはその他の測定可能な信号の変化を介して分子を検出するために使用されるナノスケールの孔。
+: 電流、イオンフロー、またはその他の測定可能な信号の変化を用いて分子を検出するナノスケールの孔。
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 ; リードマッピング
-: シーケンシングリードをリファレンスゲノムまたはリファレンスシーケンスにアラインすること。
+: シーケンシングリードをリファレンスゲノムやリファレンスシーケンスにアラインすること。
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 ; 単分子センシング
 : 一括平均だけでなく、個々の分子を検出または測定すること。
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 ; 構造変異
-: 挿入、欠失、重複、転座、または転位などの、より大きな DNA セグメントに影響を与えるゲノムの変化。
+: 挿入、欠失、重複、転座、転位などの、より大きな DNA 配列に影響を与えるゲノムの変化。
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+== References ==
+* [https://nanoporetech.com/ Oxford Nanopore file formats]
+* [https://en.wikipedia.org/wiki/FASTQ_format FASTQ format]
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