Jump to content

Event detection/de: Difference between revisions

From Nanopore Wiki
FuzzyBot (talk | contribs)
Updating to match new version of source page
FuzzyBot (talk | contribs)
Updating to match new version of source page
 
(One intermediate revision by one other user not shown)
Line 1: Line 1:
__NOTOC__
__NOTOC__
<div class="mw-translate-fuzzy">
<div class="mw-translate-fuzzy">
[[File:Detection pics scipy signal find peaks.svg|thumb|right|320px|Peak or event detection concepts support nanopore signal analysis. Source: Wikimedia Commons, CC BY-SA 4.0.]]
[[File:Patch_clamp_schematic_1.png|thumb|right|320px|Peak or event detection concepts support nanopore signal analysis. Source: Wikimedia Commons, CC BY-SA 4.0.]]
'''Ereigniserkennung''' ist Teil des Lernpfads von Nanopore Wiki. Die Ereigniserkennung erkennt echte Blockaden oder Signalveränderungen in Nanoporenaufnahmen und extrahiert daraus vergleichbare Merkmale.
'''Ereigniserkennung''' ist Teil des Lernpfads von Nanopore Wiki. Die Ereigniserkennung erkennt echte Blockaden oder Signalveränderungen in Nanoporenaufnahmen und extrahiert daraus vergleichbare Merkmale.
</div>
</div>
Line 11: Line 11:
* Falschpositive Ergebnisse können auf Störungen („Noise“), Veränderungen in den Messwerten („Drift“), ungenauen Messverfahren („Bubbles“), Verstopfungen von Messvorrichtungen sowie falschen Einstellungen der Analysesoftware zurückzuführen sein.
* Falschpositive Ergebnisse können auf Störungen („Noise“), Veränderungen in den Messwerten („Drift“), ungenauen Messverfahren („Bubbles“), Verstopfungen von Messvorrichtungen sowie falschen Einstellungen der Analysesoftware zurückzuführen sein.


<div class="mw-translate-fuzzy">
== Ablauf zur Erkennung von Ereignissen ==
== Ablauf zur Erkennung von Ereignissen ==
{| class="wikitable np-knowledge-table"
{| class="wikitable np-knowledge-table"
Line 31: Line 32:
| Exportiere Ereignistabellen und -diagramme zur Überprüfung.
| Exportiere Ereignistabellen und -diagramme zur Überprüfung.
|}
|}
</div>


<div class="mw-translate-fuzzy">
== Typische Anwendungen ==
== Typische Anwendungen ==
* Quantifizierung der Blockadetiefe und der Verweilzeit.
* Quantifizierung der Blockadetiefe und der Verweilzeit.
* Vergleich von Proben oder Porenvarianten.
* Vergleich von Proben oder Porenvarianten.
* Erstellung von Trainingsdaten für Klassifizierungsmodelle.
* Erstellung von Trainingsdaten für Klassifizierungsmodelle.
</div>


<div class="mw-translate-fuzzy">
== Häufige Fallstricke ==
== Häufige Fallstricke ==
* Für Aufnahmen mit starkem Abweichungsbereich wird ein einziges Schwellenwertkriterium verwendet.
* Für Aufnahmen mit starkem Abweichungsbereich wird ein einziges Schwellenwertkriterium verwendet.
* Es wird versäumt, falsch-positive Ergebnisse bei leeren Kontrollen zu überprüfen.
* Es wird versäumt, falsch-positive Ergebnisse bei leeren Kontrollen zu überprüfen.
* Automatisierte Ausgaben als korrekt zu betrachten, ohne sie visuell zu überprüfen.
* Automatisierte Ausgaben als korrekt zu betrachten, ohne sie visuell zu überprüfen.
</div>


<div class="mw-translate-fuzzy">
== Verwandte Seiten ==
== Verwandte Seiten ==
* [[Data analysis|Datenanalyse]]
* [[Data analysis|Datenanalyse]]
Line 47: Line 54:
* [[Single-molecule detection|Erkennung einzelner Moleküle]]
* [[Single-molecule detection|Erkennung einzelner Moleküle]]
* [[Troubleshooting|Fehlerbehebung]]
* [[Troubleshooting|Fehlerbehebung]]
</div>


<div class="mw-translate-fuzzy">
== Referenzen ==
== Referenzen ==
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Detection_theory Theorie der Signalerkennung]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Detection_theory Theorie der Signalerkennung]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Signal_processing Signalverarbeitung]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Signal_processing Signalverarbeitung]
</div>
<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
== Related pages ==
* [[Data analysis]]
* [[Noise and filtering]]
* [[Single-molecule detection]]
* [[Troubleshooting]]
</div>
<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
== References ==
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Detection_theory Signal detection theory]
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Signal_processing Signal processing]
</div>


<languages />
<languages />

Latest revision as of 09:28, 15 July 2026

Peak or event detection concepts support nanopore signal analysis. Source: Wikimedia Commons, CC BY-SA 4.0.

Ereigniserkennung ist Teil des Lernpfads von Nanopore Wiki. Die Ereigniserkennung erkennt echte Blockaden oder Signalveränderungen in Nanoporenaufnahmen und extrahiert daraus vergleichbare Merkmale.

Grundlegende Konzepte

  • Die Erkennungsschwellen sollten an den Baseline-Wert sowie die lokale „Störung“ („Noise“) angepasst werden.
  • Die Grenzen der Veranstaltungen beeinflussen Metriken wie die Verweilzeit, die Fläche und die Form der betroffenen Bereiche.
  • Schwache, sich überschneidende oder mehrstufige Ereignisse benötigen eine sorgfältige Überprüfung.
  • Falschpositive Ergebnisse können auf Störungen („Noise“), Veränderungen in den Messwerten („Drift“), ungenauen Messverfahren („Bubbles“), Verstopfungen von Messvorrichtungen sowie falschen Einstellungen der Analysesoftware zurückzuführen sein.

Ablauf zur Erkennung von Ereignissen

Schritt Beschreibung
1 Bezeichnen Sie die experimentellen Phasen sowie die Zeiten für die Hinzufügung von Beispielen.
2 Schätzen Sie den lokalen Baseline-Wert sowie die Störungen („Noise“) ab.
3 Legen Sie Schwellenwerte für Kandidaten sowie Regeln zur Mindestdauer fest.
4 Ereignisse miteinander verschmelzen, aufteilen oder ablehnen, wobei dokumentierte Kriterien angewendet werden.
5 Exportiere Ereignistabellen und -diagramme zur Überprüfung.

Typische Anwendungen

  • Quantifizierung der Blockadetiefe und der Verweilzeit.
  • Vergleich von Proben oder Porenvarianten.
  • Erstellung von Trainingsdaten für Klassifizierungsmodelle.

Häufige Fallstricke

  • Für Aufnahmen mit starkem Abweichungsbereich wird ein einziges Schwellenwertkriterium verwendet.
  • Es wird versäumt, falsch-positive Ergebnisse bei leeren Kontrollen zu überprüfen.
  • Automatisierte Ausgaben als korrekt zu betrachten, ohne sie visuell zu überprüfen.