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この用語集では、Nanopore Wiki 全体で使用される短い定義をまとめています。 | この用語集では、Nanopore Wiki 全体で使用される短い定義をまとめています。 | ||
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: ナノポア信号データをヌクレオチド配列リードに変換すること。 | : ナノポア信号データをヌクレオチド配列リードに変換すること。 | ||
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; ロングリード | ; ロングリード | ||
: 典型的なショートリードシーケンシングの出力よりもはるかに長いシーケンシングリードで、アセンブリや構造変異検出にしばしば有用です。 | : 典型的なショートリードシーケンシングの出力よりもはるかに長いシーケンシングリードで、アセンブリや構造変異検出にしばしば有用です。 | ||
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: 電流、イオンフロー、またはその他の測定可能な信号の変化を用いて分子を検出するナノスケールの孔。 | : 電流、イオンフロー、またはその他の測定可能な信号の変化を用いて分子を検出するナノスケールの孔。 | ||
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; リードマッピング | ; リードマッピング | ||
: シーケンシングリードをリファレンスゲノムやリファレンスシーケンスにアラインすること。 | : シーケンシングリードをリファレンスゲノムやリファレンスシーケンスにアラインすること。 | ||
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; 単分子センシング | ; 単分子センシング | ||
: 一括平均だけでなく、個々の分子を検出または測定すること。 | : 一括平均だけでなく、個々の分子を検出または測定すること。 | ||
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; 構造変異 | ; 構造変異 | ||
: 挿入、欠失、重複、転座、転位などの、より大きな DNA 配列に影響を与えるゲノムの変化。 | : 挿入、欠失、重複、転座、転位などの、より大きな DNA 配列に影響を与えるゲノムの変化。 | ||
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== References == | |||
* [https://nanoporetech.com/ Oxford Nanopore file formats] | |||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/FASTQ_format FASTQ format] | |||
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Latest revision as of 09:30, 15 July 2026
用語集
この用語集では、Nanopore Wiki 全体で使用される短い定義をまとめています。
- ベースコール
- ナノポア信号データをヌクレオチド配列リードに変換すること。
- ロングリード
- 典型的なショートリードシーケンシングの出力よりもはるかに長いシーケンシングリードで、アセンブリや構造変異検出にしばしば有用です。
- ナノポア
- 電流、イオンフロー、またはその他の測定可能な信号の変化を用いて分子を検出するナノスケールの孔。
- リードマッピング
- シーケンシングリードをリファレンスゲノムやリファレンスシーケンスにアラインすること。
- 単分子センシング
- 一括平均だけでなく、個々の分子を検出または測定すること。
- 構造変異
- 挿入、欠失、重複、転座、転位などの、より大きな DNA 配列に影響を与えるゲノムの変化。