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: Ein Sequenzleseabschnitt, der viel länger ist als typische kurze Sequenzleseabschnitte, oft nützlich für die Assembly und die Detektion von strukturellen Varianten. | : Ein Sequenzleseabschnitt, der viel länger ist als typische kurze Sequenzleseabschnitte, oft nützlich für die Assembly und die Detektion von strukturellen Varianten. | ||
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; Nanopore | ; Nanopore | ||
: Ein Pore im Nanometermaßstab, die zur Erfassung von Molekülen durch Änderungen des Stroms, des Ionenflusses oder anderer messbarer Signale verwendet wird. | : Ein Pore im Nanometermaßstab, die zur Erfassung von Molekülen durch Änderungen des Stroms, des Ionenflusses oder anderer messbarer Signale verwendet wird. | ||
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; Read mapping | ; Read mapping | ||
: Das Anordnen von Sequenzleseabschnitten an einem Referenzgenom oder einer Referenzsequenz. | : Das Anordnen von Sequenzleseabschnitten an einem Referenzgenom oder einer Referenzsequenz. | ||
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; Single-molecule sensing | ; Single-molecule sensing | ||
: Das Erkennen oder Messen einzelner Moleküle anstelle nur von Massendurchschnitten. | : Das Erkennen oder Messen einzelner Moleküle anstelle nur von Massendurchschnitten. | ||
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; Structural variant | ; Structural variant | ||
: Eine genomische Veränderung wie eine Einfügung, Löschung, Duplizierung, Inversion oder Translokation, die ein größeres DNSegment betrifft. | : Eine genomische Veränderung wie eine Einfügung, Löschung, Duplizierung, Inversion oder Translokation, die ein größeres DNSegment betrifft. | ||
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== References == | |||
* [https://nanoporetech.com/ Oxford Nanopore file formats] | |||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/FASTQ_format FASTQ format] | |||
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Latest revision as of 09:29, 15 July 2026
Glossar
Dieses Glossar sammelt kurze Definitionen, die im Nanopore-Wiki verwendet werden.
- Basecalling
- Die Umwandlung von Nanopore-Signaldaten in Nukleotidsequenzleseabschnitte.
- Long read
- Ein Sequenzleseabschnitt, der viel länger ist als typische kurze Sequenzleseabschnitte, oft nützlich für die Assembly und die Detektion von strukturellen Varianten.
- Nanopore
- Ein Pore im Nanometermaßstab, die zur Erfassung von Molekülen durch Änderungen des Stroms, des Ionenflusses oder anderer messbarer Signale verwendet wird.
- Read mapping
- Das Anordnen von Sequenzleseabschnitten an einem Referenzgenom oder einer Referenzsequenz.
- Single-molecule sensing
- Das Erkennen oder Messen einzelner Moleküle anstelle nur von Massendurchschnitten.
- Structural variant
- Eine genomische Veränderung wie eine Einfügung, Löschung, Duplizierung, Inversion oder Translokation, die ein größeres DNSegment betrifft.