Glossary/es

La secuenciación mediante nanoporos y la terminología de señales están conectadas entre experimentos y análisis.

Glosario es parte de la ruta de aprendizaje de Nanopore Wiki. Este glosario define términos comunes utilizados en tecnología de nanoporos, secuenciación, análisis de señales y flujos de trabajo experimentales.

Conceptos fundamentales

• Corriente de poro abierto: corriente base a través de un poro desocupado.
• Profundidad de bloqueo: la magnitud de la reducción de corriente o cambio de señal durante un evento.
• Tiempo de permanencia: la duración durante la cual una molécula produce un evento detectable.
• Basecalling: conversión de señal bruta de nanoporos en secuencia de nucleótidos y valores de calidad.
• POD5, FAST5, FASTQ y BAM: formatos de archivo comunes en los flujos de trabajo de Oxford Nanopore.

Fundamento científico

• Corriente de poro abierto: corriente base a través de un poro desocupado.
• Profundidad de bloqueo: la magnitud de la reducción de corriente o cambio de señal durante un evento.
• Las interpretaciones deben estar vinculadas a cantidades mensurables, controles experimentales y entornos de análisis documentados.
• Las afirmaciones deben distinguir las observaciones directas de la inferencia posterior.

Cómo utilizar esta página

Paso	Descripción
1	Utilice definiciones para mantener la coherencia en la redacción en todas las páginas.
2	Prefiere términos exactos como corriente de poro abierto, evento de bloqueo y puntuación Q.
3	Cuando un término tiene un significado específico de una plataforma, indique la plataforma explícitamente.

Aplicaciones habituales

• Referencia rápida para nuevos lectores.
• Coherencia editorial en las páginas traducidas.
• Soporte para la incorporación de aulas y laboratorios.

Controles de calidad

• Plataforma de registro, tipo de poro o celda de flujo, química, configuración de voltaje o adquisición y versiones de software.
• Utilice controles negativos, controles positivos y mediciones replicadas cuando la afirmación dependa de la especificidad.
• Informar limitaciones como ruido, sesgo, degradación de la muestra, inestabilidad de los poros o análisis dependiente del modelo.
• Utilice las páginas relacionadas para pasar de términos introductorios a detalles experimentales o computacionales.

Límites de interpretación

• Uso de términos de secuenciación para experimentos de nanoporos sin secuenciación sin calificación.
• Traducir formatos de archivos o nombres de instrumentos que no deben modificarse.
• Un solo resultado no debe generalizarse más allá de la muestra, el protocolo, el estado del instrumento y el proceso de análisis utilizados.
• Las decisiones médicas, legales, regulatorias o comerciales requieren una validación de dominio específico más allá de este resumen educativo.

Variante estructural

Un cambio genómico como una inserción, eliminación, duplicación, inversión o translocación que afecta a un segmento de ADN más grande.

Referencias

• Formatos de archivo Oxford Nanopore
• Formato FASTQ