Data analysis/de: Difference between revisions
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'''Datenanalyse''' ist Teil des Lernpfads von Nanopore Wiki. Die Datenanalyse mittels Nanopore-Technologie extrahiert zuverlässige Ereignisse, Merkmale und Schlussfolgerungen aus Rohdaten oder Sequenzierungsresultaten. | '''Datenanalyse''' ist Teil des Lernpfads von Nanopore Wiki. Die Datenanalyse mittels Nanopore-Technologie extrahiert zuverlässige Ereignisse, Merkmale und Schlussfolgerungen aus Rohdaten oder Sequenzierungsresultaten. | ||
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== Typische Anwendungen == | == Typische Anwendungen == | ||
* Einzelmolekülsensorik. | * Einzelmolekülsensorik. | ||
* Reihenfolgenkontrolle der Qualitätskontrolle. | * Reihenfolgenkontrolle der Qualitätskontrolle. | ||
* Methodenvergleich und Fehlerbehebung. | * Methodenvergleich und Fehlerbehebung. | ||
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== Häufige Fallstricke == | == Häufige Fallstricke == | ||
* Nur attraktive Beispielspuren werden angezeigt. | * Nur attraktive Beispielspuren werden angezeigt. | ||
* Die Schwellenwerte werden angepasst, bis die erwarteten Ergebnisse erreicht werden. | * Die Schwellenwerte werden angepasst, bis die erwarteten Ergebnisse erreicht werden. | ||
* Veröffentlichung von Tabellen mit Funktionen, ohne Nachweis der Herkunft der Rohdaten. | * Veröffentlichung von Tabellen mit Funktionen, ohne Nachweis der Herkunft der Rohdaten. | ||
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* [[Bioinformatics|Bioinformatik]] | * [[Bioinformatics|Bioinformatik]] | ||
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== Referenzen == | == Referenzen == | ||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Signal_processing Signalverarbeitung] | * [https://en.wikipedia.org/wiki/Signal_processing Signalverarbeitung] | ||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Data_analysis Datenanalyse] | * [https://en.wikipedia.org/wiki/Data_analysis Datenanalyse] | ||
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* [[Event detection]] | |||
* [[Noise and filtering]] | |||
* [[Bioinformatics]] | |||
* [[Experimental workflows]] | |||
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== References == | |||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Signal_processing Signal processing] | |||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Data_analysis Data analysis] | |||
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Latest revision as of 09:28, 15 July 2026
Datenanalyse ist Teil des Lernpfads von Nanopore Wiki. Die Datenanalyse mittels Nanopore-Technologie extrahiert zuverlässige Ereignisse, Merkmale und Schlussfolgerungen aus Rohdaten oder Sequenzierungsresultaten.
Grundlegende Konzepte
- Für die Erkennung von Veränderungen werden Rohdaten häufig als Zeitabläufe dargestellt, die die aktuellen Werte im Verlauf der Zeit zeigen.
- Für die Sequenzierung können Daten in Form von POD5, FAST5, FASTQ, BAM sowie Berichten verwendet werden.
- Die Analyse sollte die wahren Merkmale eines Ereignisses beibehalten und gleichzeitig Störungen, Abweichungen sowie Artefakte reduzieren.
- Die Qualitätskontrolle sollte vor und nach der Extraktion von Funktionen durchgeführt werden.
Analyseworkflow
| Schritt | Beschreibung |
|---|---|
| 1 | Organisieren Sie Metadaten und Rohdateien. |
| 2 | Bewerten Sie die Basislinie (Baseline), den „Rauschen“ (Noise) sowie die Abweichungen (Drift). |
| 3 | Filtern oder Trendentfernen ausschließlich mit dokumentierten Parametern. |
| 4 | Ereignisse erkennen und Merkmale wie die Blockade Tiefe sowie die Verweilzeit extrahieren. |
| 5 | Visualisieren Sie sowohl repräsentative Verläufe als auch Bevölkerungsstatistiken. |
Typische Anwendungen
- Einzelmolekülsensorik.
- Reihenfolgenkontrolle der Qualitätskontrolle.
- Methodenvergleich und Fehlerbehebung.
Häufige Fallstricke
- Nur attraktive Beispielspuren werden angezeigt.
- Die Schwellenwerte werden angepasst, bis die erwarteten Ergebnisse erreicht werden.
- Veröffentlichung von Tabellen mit Funktionen, ohne Nachweis der Herkunft der Rohdaten.