Nanopore sequencing/ja - Revision history

Nano: Machine translation from en via nanopore-translate

2026-07-15T00:44:56Z

Machine translation from en via nanopore-translate

← Older revision		Revision as of 08:44, 15 July 2026
Line 72:		Line 72:
	* オックスフォード・ナノポア・テクノロジーズ。[https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado basecallerおよび関連ツール]。		* オックスフォード・ナノポア・テクノロジーズ。[https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado basecallerおよび関連ツール]。

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== 関連ページ ==
	~~== Related pages~~ ==		* [[Nanopore technology\|ナノポア技術]]
	* [[Nanopore technology]]		* [[Oxford Nanopore\|オックスフォード・ナノポア]]
	* [[Oxford Nanopore]]		* [[MinION\|ミニオン（MinION）]]
	* [[MinION]]		* [[Bioinformatics\|バイオインフォマティクス]]
	* [[Bioinformatics]]		* [[Machine learning\|機械学習]]
	* [[Machine learning]]		* [[Data analysis\|データ分析]]
	* [[Data analysis]]		* [[Event detection\|イベント検出]]
	* [[Event detection]]		* [[Glossary\|用語集]]
	* [[Glossary]]
	~~</div>~~

	<languages />		<languages />

Nano: Machine translation from en via nanopore-translate

2026-07-14T15:42:44Z

Machine translation from en via nanopore-translate

← Older revision		Revision as of 23:42, 14 July 2026
Line 57:		Line 57:
	生のナノポアデータおよび処理済みのナノポアデータには、POD5やFAST5のシグナルファイル、FASTQファイル、BAMやCRAMのアライメントデータ、シーケンシングの要約ファイル、修正された塩基情報を示すタグ、および実験結果のレポートなどが含まれることがあります。適切な分析を行うためには、使用した装置、フローセルの種類、使用した化学試薬、使用したキット、塩基配列の解析ソフトウェア（ベースコーラー）、モデルのバージョン、参照データベース、およびコマンドラインで指定されたパラメータなどを記録することが重要です。		生のナノポアデータおよび処理済みのナノポアデータには、POD5やFAST5のシグナルファイル、FASTQファイル、BAMやCRAMのアライメントデータ、シーケンシングの要約ファイル、修正された塩基情報を示すタグ、および実験結果のレポートなどが含まれることがあります。適切な分析を行うためには、使用した装置、フローセルの種類、使用した化学試薬、使用したキット、塩基配列の解析ソフトウェア（ベースコーラー）、モデルのバージョン、参照データベース、およびコマンドラインで指定されたパラメータなどを記録することが重要です。

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== '''良い慣行（Good Practice）''' ==
	~~== Good practice~~ ==		* 収量を最適化する前に、生物学的な疑問に合わせてプロトコルを選択してください。
	* ~~Match the protocol to the biological question before optimizing yield.~~		* ライブラリー、ポア（pore）、サンプル、および分析の効果を区別するためにコントロールを使用してください。
	* ~~Use controls to separate library, pore, sample, and analysis effects.~~		* 化学反応の種類、ベースコーラー（basecaller）、モデルのバージョン、および分析に使用されたパラメータを報告してください。
	* ~~Report chemistry, basecaller, model version, and analysis parameters.~~		* 代表的な読み方の両方と集計統計の両方を検証してください。
	* ~~Inspect both representative reads and aggregate statistics.~~		* 可能であれば、影響の大きい結論を独立した証拠によって検証してください。
	* ~~Validate high-impact conclusions with independent evidence when possible.~~
	~~</div>~~

	== 選定された論文とリソース ==		== 選定された論文とリソース ==

Nano: Machine translation from en via nanopore-translate

2026-07-14T13:46:04Z

Machine translation from en via nanopore-translate

← Older revision		Revision as of 21:46, 14 July 2026
Line 45:		Line 45:
	* 臨床現場、規制環境、または重大な結果を伴う状況においては、慎重な管理が求められる。		* 臨床現場、規制環境、または重大な結果を伴う状況においては、慎重な管理が求められる。

	~~<div class~~=~~"mw-translate-fuzzy">~~		== アプリケーション ==
	* ~~[[Oxford Nanopore]]~~		* '''ゲノムアセンブリ''' – 長い読み取りデータ（long reads）は、反復配列の解決や構造的な複雑さの解明に役立ちます。
	* ~~[[MinION]]~~		* '''構造的変異''' – 長い配列の変化には、挿入、削除、逆転、転座、および繰り返しの拡張などが含まれる。
	* ~~[[Bioinformatics]]~~		* '''微生物ゲノミクス''' – 迅速な同定、抗菌薬耐性の分析、プラスミドの再構築、および感染症の追跡。
	* ~~[[Glossary]]~~		* '''メタゲノミクスと環境DNA''' – 混合サンプルのリアルタイム分類、および厳格な汚染防止対策
	~~</div>~~		* '''トランスクリプトミクスと直接RNA解析''' – 選択されたワークフローにおけるアイソフォームレベルの情報およびRNA修飾のシグナル
			* '''エピジェネティクスと塩基修飾''' – モデルおよび対照群が適切な場合におけるメチル化やその他の塩基修飾の検出。
			* '''適応型サンプリング''' – 分子の配列決定を続行するかどうかを判断することにより、ターゲットをリアルタイムで増幅または減少させる手法。

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class~~=~~"mw-content-ltr">~~		== データとファイルの種類 ==
	=~~= Data and file types ==~~		生のナノポアデータおよび処理済みのナノポアデータには、POD5やFAST5のシグナルファイル、FASTQファイル、BAMやCRAMのアライメントデータ、シーケンシングの要約ファイル、修正された塩基情報を示すタグ、および実験結果のレポートなどが含まれることがあります。適切な分析を行うためには、使用した装置、フローセルの種類、使用した化学試薬、使用したキット、塩基配列の解析ソフトウェア（ベースコーラー）、モデルのバージョン、参照データベース、およびコマンドラインで指定されたパラメータなどを記録することが重要です。
	Raw and processed nanopore data may include POD5 or FAST5 signal files, FASTQ reads, BAM or CRAM alignments, sequencing-summary files, modified-base tags, and run reports. Good analysis practice records the instrument, flow cell, chemistry, kit, basecaller, model version, reference database, and command-line parameters.
	~~</div>~~

	<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
Line 66:		Line 66:
	</div>		</div>

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== 選定された論文とリソース ==
	~~== Selected papers and resources~~ ==		* ディーマー・D、アケソン・M、ブラントン・D. 「30年にわたるナノポアシーケンシング」. ''Nature Biotechnology''. 2016.
	* ~~Deamer D, Akeson M, Branton D. [https://www~~.~~nature.com/articles/nbt.3423 Three decades of nanopore sequencing]~~. ''Nature Biotechnology''. 2016.		* Jain Mら. 「ナノポアシーケンシングと超長読長を用いたヒトゲノムのアセンブリ」（Jain M et al. “Nanopore sequencing and human genome assembly using ultra-long read lengths”）. ''Nature Biotechnology''. 2018年.
	* Jain M et al. ~~[https://www.nature.com/articles/nbt.4060 Nanopore~~ sequencing and ~~assembly of a~~ human genome ~~with~~ ultra-long ~~reads]~~. ''Nature Biotechnology''. ~~2018~~.		* Wick RR, Judd LM, Holt KE. [https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1727-y オックスフォード・ナノポアシーケンシング用のニューラルネットワークベースのツールの性能]. ''Genome Biology''. 2019.
	* Wick RR, Judd LM, Holt KE. [https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1727-y ~~Performance of neural network basecalling tools for Oxford Nanopore sequencing~~]. ''Genome Biology''. 2019.		* 王Yら. 「ナノポアシーケンシング技術、バイオインフォマティクス、およびその応用」. ''Nature Biotechnology''. 2021.
	* ~~Wang Y et al~~. ~~[https://www.nature.com/articles/s41587-021-01108-x Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications]~~. ''Nature Biotechnology''. 2021.		* Kovaka Sら. [https://www.nature.com/articles/s41587-020-0731-9 ターゲットを絞ったナノポアシーケンシング：未処理の電気信号をリアルタイムでマッピングすることによる手法（UNCALLED）]. ''Nature Biotechnology''. 2021.
	* Kovaka ~~S et al~~. [https://www.nature.com/articles/s41587-020-0731-9 ~~Targeted nanopore sequencing by real-time mapping of raw electrical signal with UNCALLED~~]. ''Nature Biotechnology''. 2021.		* オックスフォード・ナノポア・テクノロジーズ。[https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado basecallerおよび関連ツール]。
	* ~~Oxford Nanopore Technologies.~~ [https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado ~~basecaller and related tools~~].
	~~</div>~~

	<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">

Nano: Machine translation from en via nanopore-translate

2026-07-14T13:34:43Z

Machine translation from en via nanopore-translate

← Older revision		Revision as of 21:34, 14 July 2026
Line 6:		Line 6:
	ナノポアシーケンシングの科学的価値は、以下の4つの特性に由来する：長い読み取り範囲、リアルタイムでのデータ取得、直接的な電気的検出、そして携帯可能な測定装置である。これらの特性により、ゲノムアセンブリ、構造変異の解析、微生物の監視、疫病対策、環境DNAの解析、トランスクリプトミクス、および特定のヌクレオチド修飾の直接検出などに有用である。		ナノポアシーケンシングの科学的価値は、以下の4つの特性に由来する：長い読み取り範囲、リアルタイムでのデータ取得、直接的な電気的検出、そして携帯可能な測定装置である。これらの特性により、ゲノムアセンブリ、構造変異の解析、微生物の監視、疫病対策、環境DNAの解析、トランスクリプトミクス、および特定のヌクレオチド修飾の直接検出などに有用である。

	~~<div class~~=~~"mw-translate-fuzzy">~~		== 原則 ==
	=~~= 特徴~~ ==		ナノポアシーケンシングの測定には3つの連携した層がある：
	~~</div>~~		* '''分子層''' – DNAまたはRNA鎖はアダプターを用いて準備され、酵素やモータータンパク質によって孔を通して導かれる。
			* '''物理層''' – センシング領域内の基準値や短いk-mer（k-merとは、特定の配列パターンのこと）が、イオン電流やその他の測定可能な信号を変調する。
			* '''計算層''' – 信号処理およびベースコール処理により、時系列データが読み取りデータ、品質スコア、および後続の分析用ファイルに変換されます。

	~~<div class="mw~~-~~translate-fuzzy">~~		通常、単一の現在レベルは孤立したベースに割り当てられることはありません。測定された信号は、局所的な配列の文脈、孔の化学的性質、モーターの速度、温度、バッファー、電子回路、およびモデルのバージョンに依存します。このため、ベースコール（basecalling）や修正ベースの検出（modified-base detection）は、単純な参照テーブルではなく、モデルに基づいた処理となります。
	* 長いリードでゲノムアセンブリや構造変異の検出に役立つ。
	* リアルタイムのデータ生成と分析。
	* 多くのワークフローで直接DNAやRNAを検出。
	* 携帯可能な機器で、現場や迅速な対応に適している。
	~~</div>~~

	~~<div~~ class="mw-~~translate~~-~~fuzzy~~">		== サンプルから結果へのワークフロー ==
	~~== 一般的なワークフロー ==~~		{\| class="wikitable np-knowledge-table"
	~~</div>~~		! ステージ！！主な質問！！通常の出力！！品質チェック
			\|-
			\| サンプルおよびライブラリの準備 \|\| 核酸が長く、汚染がなく、キットと互換性があるか？ \|\| シーケンシングに適したライブラリ \|\| 入力質量、断片長、阻害剤、アダプターのリガーション効率
			\|-
			\| シーケンス実行の順序 \|\| 足りるだけの活性なポアが安定した読み取りを実現しているか？ \|\| 生の信号データと実行メトリクス \|\| 時間経過に伴うポアの活性、読み取り長さの分布、収量、品質
			\|-
			\| '''Basecalling \|\| 生の信号を最もよく説明するシーケンスは何か？ \|\| FASTQかBAMか \|\| 読み取りの正確性、品質スコア、モデルと化学的な互換性'''
			\|-
			\| '''アライメントまたは分類 \|\| リードデータはどこから来るのか？ \|\| マッピングされたリードデータ、分類群、またはコンティグ \|\| マッピングの品質、カバレッジ、汚染、参照バイアス'''
			\|-
			\| 解釈 \|\| どのような生物学的または技術的な結論が支持されているか？ \|\| バリアント、アセンブリ、メチル化の検出、報告書 \|\| 必要に応じて、制御、再現性、閾値、正交検証
			\|}

	~~<div class~~=~~"mw-translate-fuzzy">~~		== 強み ==
	~~# サンプル準備とライブラリ構築。~~		* 「ロングリード（Long Reads）」とは、反復配列、構造的変異体、ハプロタイプ、プラスミド、そして複雑なゲノム領域にわたる配列データを指す。
	~~# ナノポアデバイスでのシークエンシング。~~		* 「リアルタイムシーケンシング」により、実行中に分析を行うことができ、迅速な意思決定をサポートします。
	~~# 生の信号からヌクレオチドシークエンスへのベースコール。~~		* '''直接検出'''により、DNAやRNAの特定の修飾に関する情報を保持することができる。
	~~# 品質管理とフィルタリング。~~		* '''ポータブル機器'''により、現場での作業、教育、およびインフラが整っていない環境での作業が可能になります。
	~~# アライメント、アセンブリ、変異検出、またはメタゲノム分類。~~		* '''フレキシブルなスループット'''により、小規模でターゲットを絞った実験や、大規模なゲノム規模のプロジェクトの両方が可能になります。
	~~# 解釈と報告。~~
	~~</div>~~

	~~<div class~~=~~"mw-translate-fuzzy">~~		== 制限事項とエラーの原因 ==
	=~~= 関連ページ~~ ==		ナノポアシーケンシングを短読みシーケンシングよりも自動的に優れていると見なすべきではない。その適切性は、研究の目的、使用するサンプル、求められる精度、コスト、および解析プロセスに依存する。重要な制限事項としては以下のようなものがある：
	~~</div>~~		* 生の読み取りエラーと、システム的な文脈依存型のエラー。
			* サンプル品質の感度性能、特に長時間読み込みが必要なアプリケーションにおいて。
			* 化学反応、細孔構造、およびモデルのバージョン依存性。
			* ホモポリマーおよび改変された塩基に関する解釈上の課題（特定の文脈において）
			* ベースコールイング（basecalling）、アライメント（alignment）、アセンブリ（assembly）、バリアントコールイング（variant calling）に必要な計算リソース（Computational requirements for basecalling, alignment, assembly, and variant calling）。
			* 臨床現場、規制環境、または重大な結果を伴う状況においては、慎重な管理が求められる。

	<div class="mw-translate-fuzzy">		<div class="mw-translate-fuzzy">

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2026-07-14T13:28:33Z

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Line 1:		Line 1:
	~~<span id="Nanopore_sequencing"></span>~~		__NOTOC__
	= ~~ナノポアシークエンシング~~ =		= ナノポアシーケンシング =
			[[File:Nanopore_DNA_sequencing.png\|thumb\|right\|320px\|A DNA molecule passing through a nanopore can produce a signal that is interpreted as sequence information. Source: Wikimedia Commons, CC BY 4.0.]]
			'''ナノポアシーケンシング'''とは、DNAやRNA分子がナノポアを通過する際に生じる信号変化を計算処理によって配列情報に変換する、単一分子シーケンシング手法です。実際のシステムでは、モータータンパク質が分子の動きを制御し、複数のナノポアが並行して動作し、ニューラルネットワークを用いた解析エンジンが原始的な信号を配列データに変換します。

	'''ナノポアシークエンシング'''は、個々のDNAやRNA分子がナノポアを通過し、その信号の変化をシークエンス情報として解釈できるシークエンシング手法です。		ナノポアシーケンシングの科学的価値は、以下の4つの特性に由来する：長い読み取り範囲、リアルタイムでのデータ取得、直接的な電気的検出、そして携帯可能な測定装置である。これらの特性により、ゲノムアセンブリ、構造変異の解析、微生物の監視、疫病対策、環境DNAの解析、トランスクリプトミクス、および特定のヌクレオチド修飾の直接検出などに有用である。

	<~~span id~~="~~Features~~"~~></span~~>		<div class="mw-translate-fuzzy">
	== 特徴 ==		== 特徴 ==
			</div>

			<div class="mw-translate-fuzzy">
	* 長いリードでゲノムアセンブリや構造変異の検出に役立つ。		* 長いリードでゲノムアセンブリや構造変異の検出に役立つ。
	* リアルタイムのデータ生成と分析。		* リアルタイムのデータ生成と分析。
	* 多くのワークフローで直接DNAやRNAを検出。		* 多くのワークフローで直接DNAやRNAを検出。
	* 携帯可能な機器で、現場や迅速な対応に適している。		* 携帯可能な機器で、現場や迅速な対応に適している。
			</div>

	<~~span id~~="~~Common_workflow~~"~~></span~~>		<div class="mw-translate-fuzzy">
	== 一般的なワークフロー ==		== 一般的なワークフロー ==
			</div>

			<div class="mw-translate-fuzzy">
	# サンプル準備とライブラリ構築。		# サンプル準備とライブラリ構築。
	# ナノポアデバイスでのシークエンシング。		# ナノポアデバイスでのシークエンシング。
Line 21:		Line 28:
	# アライメント、アセンブリ、変異検出、またはメタゲノム分類。		# アライメント、アセンブリ、変異検出、またはメタゲノム分類。
	# 解釈と報告。		# 解釈と報告。
			</div>

	<~~span id~~="~~Related_pages~~"~~></span~~>		<div class="mw-translate-fuzzy">
	== 関連ページ ==		== 関連ページ ==
			</div>

			<div class="mw-translate-fuzzy">
	* [[Oxford Nanopore]]		* [[Oxford Nanopore]]
	* [[MinION]]		* [[MinION]]
	* [[Bioinformatics]]		* [[Bioinformatics]]
	* [[Glossary]]		* [[Glossary]]
			</div>

			<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			== Data and file types ==
			Raw and processed nanopore data may include POD5 or FAST5 signal files, FASTQ reads, BAM or CRAM alignments, sequencing-summary files, modified-base tags, and run reports. Good analysis practice records the instrument, flow cell, chemistry, kit, basecaller, model version, reference database, and command-line parameters.
			</div>

			<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			== Good practice ==
			* Match the protocol to the biological question before optimizing yield.
			* Use controls to separate library, pore, sample, and analysis effects.
			* Report chemistry, basecaller, model version, and analysis parameters.
			* Inspect both representative reads and aggregate statistics.
			* Validate high-impact conclusions with independent evidence when possible.
			</div>

			<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			== Selected papers and resources ==
			* Deamer D, Akeson M, Branton D. [https://www.nature.com/articles/nbt.3423 Three decades of nanopore sequencing]. ''Nature Biotechnology''. 2016.
			* Jain M et al. [https://www.nature.com/articles/nbt.4060 Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads]. ''Nature Biotechnology''. 2018.
			* Wick RR, Judd LM, Holt KE. [https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1727-y Performance of neural network basecalling tools for Oxford Nanopore sequencing]. ''Genome Biology''. 2019.
			* Wang Y et al. [https://www.nature.com/articles/s41587-021-01108-x Nanopore sequencing technology, bioinformatics and applications]. ''Nature Biotechnology''. 2021.
			* Kovaka S et al. [https://www.nature.com/articles/s41587-020-0731-9 Targeted nanopore sequencing by real-time mapping of raw electrical signal with UNCALLED]. ''Nature Biotechnology''. 2021.
			* Oxford Nanopore Technologies. [https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado basecaller and related tools].
			</div>

			<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			== Related pages ==
			* [[Nanopore technology]]
			* [[Oxford Nanopore]]
			* [[MinION]]
			* [[Bioinformatics]]
			* [[Machine learning]]
			* [[Data analysis]]
			* [[Event detection]]
			* [[Glossary]]
			</div>

	<languages />		<languages />

Nano: Update ja translation via SiliconFlow batch

2026-06-29T04:25:16Z

Update ja translation via SiliconFlow batch

← Older revision		Revision as of 12:25, 29 June 2026
Line 1:		Line 1:
	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Nanopore_sequencing"></span>
	= ~~Nanopore sequencing~~ =		= ナノポアシークエンシング =
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		'''ナノポアシークエンシング'''は、個々のDNAやRNA分子がナノポアを通過し、その信号の変化をシークエンス情報として解釈できるシークエンシング手法です。
	'''~~Nanopore sequencing~~''' ~~is a sequencing approach in which individual DNA or RNA molecules pass through nanopores and produce signal changes that can be interpreted as sequence information.~~
	~~</div>~~

	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Features"></span>
	== ~~Features~~ ==		== 特徴 ==
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		* 長いリードでゲノムアセンブリや構造変異の検出に役立つ。
	* ~~Long reads that can help with genome assembly and structural variant detection.~~		* リアルタイムのデータ生成と分析。
	* ~~Real-time data generation and analysis.~~		* 多くのワークフローで直接DNAやRNAを検出。
	* ~~Direct DNA or RNA sensing in many workflows.~~		* 携帯可能な機器で、現場や迅速な対応に適している。
	* ~~Portable instruments suitable for field and rapid-response settings.~~
	~~</div>~~

	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Common_workflow"></span>
	== ~~Common workflow~~ ==		== 一般的なワークフロー ==
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		# サンプル準備とライブラリ構築。
	# ~~Sample preparation and library construction.~~		# ナノポアデバイスでのシークエンシング。
	# ~~Sequencing on a nanopore device.~~		# 生の信号からヌクレオチドシークエンスへのベースコール。
	# ~~Basecalling from raw signal to nucleotide sequence.~~		# 品質管理とフィルタリング。
	# ~~Quality control and filtering.~~		# アライメント、アセンブリ、変異検出、またはメタゲノム分類。
	# ~~Alignment, assembly, variant calling, or metagenomic classification.~~		# 解釈と報告。
	# ~~Interpretation and reporting.~~
	~~</div>~~

	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Related_pages"></span>
	== ~~Related pages~~ ==		== 関連ページ ==
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~
	* [[Oxford Nanopore]]		* [[Oxford Nanopore]]
	* [[MinION]]		* [[MinION]]
	* [[Bioinformatics]]		* [[Bioinformatics]]
	* [[Glossary]]		* [[Glossary]]
	~~</div>~~

	<languages />		<languages />

FuzzyBot: Updating to match new version of source page

2026-06-28T15:06:09Z

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← Older revision		Revision as of 23:06, 28 June 2026
Line 1:		Line 1:
	<div class="~~plainlinks~~">~~'''Languages:''' [[~~Nanopore sequencing~~\|English]] \| [[Nanopore sequencing/zh\|中文]] \| [[Nanopore sequencing/es\|español]] \| [[Nanopore sequencing/fr\|français]] \| [[Nanopore sequencing/de\|Deutsch]] \| [[Nanopore sequencing/ja\|日本語]]~~</div>		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			= Nanopore sequencing =
			</div>

	= ~~ナノポアシークエンシング~~ =		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			'''Nanopore sequencing''' is a sequencing approach in which individual DNA or RNA molecules pass through nanopores and produce signal changes that can be interpreted as sequence information.
			</div>

	'''ナノポアシークエンシング'''は、個々のDNAやRNA分子がナノポアを通過し、その信号の変化をシークエンス情報として解釈するシークエンシング手法です。		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			== Features ==
			</div>

	== ~~特徴 =~~=		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			* Long reads that can help with genome assembly and structural variant detection.
			* Real-time data generation and analysis.
			* Direct DNA or RNA sensing in many workflows.
			* Portable instruments suitable for field and rapid-response settings.
			</div>

	* ゲノムアセンブリや構造変異検出に役立つ長いリード。		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
	* リアルタイムのデータ生成と分析。		== Common workflow ==
	* 多くのワークフローで直接DNAやRNAを検出。		</div>
	* 携帯可能な機器で、現場や迅速な対応に適しています。

	== ~~一般的なワークフロー =~~=		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			# Sample preparation and library construction.
			# Sequencing on a nanopore device.
			# Basecalling from raw signal to nucleotide sequence.
			# Quality control and filtering.
			# Alignment, assembly, variant calling, or metagenomic classification.
			# Interpretation and reporting.
			</div>

	~~# サンプル準備とライブラリ構築。~~		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
	~~# ナノポアデバイスでのシークエンシング。~~		== Related pages ==
	~~# 生の信号からヌクレオチドシークエンスへのベースコール。~~		</div>
	~~# 品質管理とフィルタリング。~~
	~~# アライメント、アセンブリ、変異コール、またはメタゲノム分類。~~
	~~# 解釈と報告。~~

	== ~~関連ページ =~~=		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			* [[Oxford Nanopore]]
			* [[MinION]]
			* [[Bioinformatics]]
			* [[Glossary]]
			</div>

	* [[Oxford Nanopore\|Oxford Nanopore]]		<languages />
	* [[MinION\|MinION]]
	* [[Bioinformatics\|バイオインフォマティクス]]
	* [[Glossary\|用語集]]

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2026-06-28T14:03:05Z

Fix mojibake question-mark link labels

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Line 25:		Line 25:
	* [[Oxford Nanopore\|Oxford Nanopore]]		* [[Oxford Nanopore\|Oxford Nanopore]]
	* [[MinION\|MinION]]		* [[MinION\|MinION]]
	* [[Bioinformatics\|~~????????????~~]]		* [[Bioinformatics\|バイオインフォマティクス]]
	* [[Glossary\|~~???~~]]		* [[Glossary\|用語集]]

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2026-06-28T13:59:01Z

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= ナノポアシークエンシング =

'''ナノポアシークエンシング'''は、個々のDNAやRNA分子がナノポアを通過し、その信号の変化をシークエンス情報として解釈するシークエンシング手法です。

== 特徴 ==

* ゲノムアセンブリや構造変異検出に役立つ長いリード。
* リアルタイムのデータ生成と分析。
* 多くのワークフローで直接DNAやRNAを検出。
* 携帯可能な機器で、現場や迅速な対応に適しています。

== 一般的なワークフロー ==

# サンプル準備とライブラリ構築。
# ナノポアデバイスでのシークエンシング。
# 生の信号からヌクレオチドシークエンスへのベースコール。
# 品質管理とフィルタリング。
# アライメント、アセンブリ、変異コール、またはメタゲノム分類。
# 解釈と報告。

== 関連ページ ==

* [[Oxford Nanopore]]
* [[MinION]]
* [[Bioinformatics]]
* [[Glossary]]

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