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	* Oxford Nanopore Technologies. [https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado basecaller y herramientas relacionadas].		* Oxford Nanopore Technologies. [https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado basecaller y herramientas relacionadas].

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== Páginas relacionadas ==
	~~== Related pages~~ ==		* [[Nanopore technology\|Tecnología de nanoporos]]
	* [[Nanopore technology]]		* [[Oxford Nanopore\|Oxford Nanopore]]
	* [[Oxford Nanopore]]		* [[MinION\|MinION]]
	* [[MinION]]		* [[Bioinformatics\|'''Bioinformática''']]
	* [[Bioinformatics]]		* [[Machine learning\|Aprendizaje automático]]
	* [[Machine learning]]		* [[Data analysis\|Análisis de datos]]
	* [[Data analysis]]		* [[Event detection\|Detección de eventos]]
	* [[Event detection]]		* [[Glossary\|Glosario]]
	* [[Glossary]]
	~~</div>~~

	<languages />		<languages />

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2026-07-14T13:45:23Z

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	* Es necesaria una supervisión cuidadosa en entornos clínicos, regulatorios o de gran importancia.		* Es necesaria una supervisión cuidadosa en entornos clínicos, regulatorios o de gran importancia.

	~~<div class~~=~~"mw-translate-fuzzy">~~		== Aplicaciones ==
	* ~~[[Oxford Nanopore]]~~		* '''Asamblea de genomas''': Las lecturas largas ayudan a resolver las repeticiones y la complejidad estructural.
	* ~~[[MinION]]~~		* '''Variedad estructural''': Las lecturas extensas pueden incluir inserciones, eliminaciones, inversiones, translocaciones y expansiones repetidas.
	* ~~[[Bioinformatics\|Bioinformática]]~~		* '''Genómica microbiana''': identificación rápida, análisis de la resistencia a los antimicrobianos, reconstrucción de plásmidos y seguimiento de brotes.
	* ~~[[Glossary\|Glosario]]~~		* '''Metagenómica y ADN ambiental''': clasificación en tiempo real de muestras mixtas, con un cuidadoso control de la contaminación.
	~~</div>~~		* '''Transcriptómica y ARN directo''': información a nivel de isoformas y señales de modificación del ARN en flujos de trabajo seleccionados.
			* '''Epigenética y modificaciones en las bases genéticas''': detección de la metilación y otras modificaciones cuando los modelos y los grupos de control sean adecuados.
			* '''Muestreo adaptativo''': enriquecimiento o disminución en tiempo real de los objetivos de análisis, mediante la decisión de continuar secuenciando una molécula o no.

	~~<div lang~~=~~"en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		== Datos y tipos de archivos ==
	=~~= Data and file types~~ ==		Los datos brutos y procesados de nanoporos pueden incluir archivos de señales en formato POD5 o FAST5, lecturas en formato FASTQ, alineamientos de secuencias en formato BAM o CRAM, archivos de resumen de secuenciación, etiquetas de bases modificadas y informes de ejecución. Una buena práctica de análisis registra el instrumento utilizado, la celda de flujo, los reactivos químicos empleados, el kit utilizado para el análisis, el software utilizado para la identificación de bases (basecaller), la versión del modelo, la base de datos de referencia y los parámetros de la línea de comandos.
	~~Raw and processed nanopore data may include~~ POD5 or FAST5 ~~signal files~~, FASTQ ~~reads~~, BAM or CRAM ~~alignments~~, ~~sequencing-summary files, modified-base tags~~, ~~and run reports~~. ~~Good analysis practice records the instrument~~, ~~flow cell~~, ~~chemistry~~, kit, basecaller, ~~model version~~, ~~reference database, and command-line parameters~~.
	~~</div>~~

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== Buena práctica ==
	~~== Good practice~~ ==		* Ajuste el protocolo en función de la pregunta biológica antes de optimizar el rendimiento.
	* ~~Match the protocol to the biological question before optimizing yield~~.		* Use controles para separar los efectos de la biblioteca, el poro, la muestra y el análisis.
	* Use ~~controls to separate library, pore~~, ~~sample~~, ~~and analysis effects~~.		* Reporte los datos de química, el método utilizado para la identificación de compuestos (basecaller), la versión del modelo y los parámetros de análisis.
	* ~~Report chemistry~~, basecaller, ~~model version, and analysis parameters~~.		* Examine tanto las lecturas representativas como las estadísticas agregadas.
	* ~~Inspect both representative reads and aggregate statistics~~.		* Valida las conclusiones de alto impacto con evidencia independiente siempre que sea posible.
	* ~~Validate high-impact conclusions with independent evidence when possible~~.
	~~</div>~~

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== Artículos y recursos seleccionados ==
	~~== Selected papers and resources~~ ==		* Deamer D, Akeson M, Branton D. [https://www.nature.com/articles/nbt.3423 Tres décadas de secuenciación de nanoporos]. ''Nature Biotechnology''. 2016.
	* Deamer D, Akeson M, Branton D. [https://www.nature.com/articles/nbt.3423 ~~Three decades of nanopore sequencing~~]. ''Nature Biotechnology''. 2016.		* Jain M et al. [https://www.nature.com/articles/nbt.4060 Secuenciación por nanoporos y ensamblaje de un genoma humano mediante lecturas ultralargas]. ''Nature Biotechnology''. 2018.
	* Jain M et al. [https://www.nature.com/articles/nbt.4060 ~~Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads~~]. ''Nature Biotechnology''. 2018.		* Wick RR, Judd LM, Holt KE. [https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1727-y Rendimiento de las herramientas de basecalling basadas en redes neuronales para el secuenciamiento de Oxford Nanopore]. ''Genome Biology''. 2019.
	* Wick RR, Judd LM, Holt KE. [https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1727-y ~~Performance of neural network~~ basecalling ~~tools for~~ Oxford Nanopore ~~sequencing~~]. ''Genome Biology''. 2019.		* Wang Y et al. [https://www.nature.com/articles/s41587-021-01108-x Tecnología de secuenciación por nanoporos, bioinformática y aplicaciones]. ''Nature Biotechnology''. 2021.
	* Wang Y et al. [https://www.nature.com/articles/s41587-021-01108-x ~~Nanopore sequencing technology~~, ~~bioinformatics and applications~~]. ''Nature Biotechnology''. 2021.		* Kovaka S et al. [https://www.nature.com/articles/s41587-020-0731-9 Secuenciación de nanoporos dirigida mediante el mapeo en tiempo real de la señal eléctrica bruta con UNCALLED]. ''Nature Biotechnology''. 2021.
	* Kovaka S et al. [https://www.nature.com/articles/s41587-020-0731-9 ~~Targeted nanopore sequencing by~~ real~~-time mapping of raw electrical signal with~~ UNCALLED]. ''Nature Biotechnology''. 2021.		* Oxford Nanopore Technologies. [https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado basecaller y herramientas relacionadas].
	* Oxford Nanopore Technologies. [https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado basecaller ~~and related tools~~].
	~~</div>~~

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-<span id="Nanopore_sequencing"></span>
+__NOTOC__
 = Secuenciación por nanoporos =
-'''Secuenciación por nanoporos''' es un enfoque de secuenciación en el que las moléculas de ADN o ARN individuales pasan a través de nanoporos y producen cambios de señal que pueden interpretarse como información de secuencia.
+El valor científico del secuenciamiento de nanoporos proviene de cuatro propiedades clave: lecturas de larga duración, adquisición de datos en tiempo real, detección eléctrica directa e instrumentación portátil. Estas características lo hacen útil para el ensamblaje de genomas, el análisis de variantes estructurales, la vigilancia microbiana, la respuesta a brotes epidémicos, el secuenciamiento ambiental, la transcriptómica y la detección directa de algunas modificaciones en los nucleótidos.
-<span id="Features"></span>
+== Principio ==
-== Características ==
+Una medición de secuenciación por nanoporos consta de tres capas acopladas:
-* Lecturas largas que pueden ayudar con la ensamblaje del genoma y la detección de variantes estructurales.
+Por lo general, no se asigna un único nivel actual a una base aislada. La señal medida depende del contexto de la secuencia local, de la química de los poros, de la velocidad del motor, de la temperatura, del buffer, de la electrónica y de la versión del modelo. Por esta razón, el proceso de identificación de bases (basecalling) y la detección de bases modificadas (modified-base detection) son tareas basadas en modelos, y no simplemente tablas de consulta.
-<span id="Common_workflow"></span>
+== Flujo de trabajo desde el ejemplo hasta el resultado ==
-== Flujo de trabajo común =
+{| class="wikitable np-knowledge-table"
-# Preparación de muestras y construcción de biblioteca.
+== '''Fortalezas''' ==
-# Secuenciación en un dispositivo de nanoporos.
+* Los '''textos extensos''' pueden abarcar repeticiones, variantes estructurales, haplotipos, plásmidos y regiones genómicas complejas.
-# Basecalling de la señal cruda a la secuencia de nucleótidos.
+* La '''secuenciación en tiempo real''' permite el análisis durante el proceso y respalda la toma de decisiones rápidas.
-# Control de calidad y filtrado.
+* La '''sensación directa''' puede conservar información sobre algunas modificaciones en el ADN o ARN.
-# Alineamiento, ensamblaje, llamada de variantes o clasificación metagenómica.
+* Los '''instrumentos portátiles''' hacen posibles los trabajos en el campo, la enseñanza y los procesos que requieren poca infraestructura.
-# Interpretación y reporte.
+* La '''capacidad de procesamiento flexible''' (flexible throughput) permite realizar operaciones de análisis de datos de pequeña escala y proyectos a gran escala que involucran genomas completos.
-<span id="Related_pages"></span>
+== Limitaciones y fuentes de errores ==
-== Páginas relacionadas =
+El secuenciamiento mediante nanoporos no debería considerarse automáticamente superior al secuenciamiento de lecturas cortas. Su idoneidad depende del problema de investigación, de la muestra analizada, de la precisión requerida, del costo y del proceso de análisis utilizado. Algunas limitaciones importantes incluyen:
 * [[Oxford Nanopore]]
 * [[MinION]]
 * [[Bioinformatics|Bioinformática]]
 * [[Glossary|Glosario]]
 <languages />

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2026-06-30T03:13:23Z

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	* [[Oxford Nanopore]]		* [[Oxford Nanopore]]
	* [[MinION]]		* [[MinION]]
	* [[Bioinformática]]		* [[Bioinformatics\|Bioinformática]]
	* [[Glosario]]		* [[Glossary\|Glosario]]

	<languages />		<languages />

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	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Nanopore_sequencing"></span>
	= ~~Nanopore sequencing~~ =		= Secuenciación por nanoporos =
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		'''Secuenciación por nanoporos''' es un enfoque de secuenciación en el que las moléculas de ADN o ARN individuales pasan a través de nanoporos y producen cambios de señal que pueden interpretarse como información de secuencia.
	'''~~Nanopore sequencing~~''' is a ~~sequencing approach in which individual DNA or RNA molecules pass through nanopores and produce signal changes that can be interpreted as sequence information~~.
	~~</div>~~

	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Features"></span>
	== ~~Features~~ ==		== Características ==
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		* Lecturas largas que pueden ayudar con la ensamblaje del genoma y la detección de variantes estructurales.
	* ~~Long reads that can help with genome assembly and structural variant detection~~.		* Generación y análisis de datos en tiempo real.
	* ~~Real-time data generation and analysis~~.		* Sensado directo de ADN o ARN en muchos flujos de trabajo.
	* ~~Direct DNA or RNA sensing in many workflows~~.		* Instrumentos portátiles adecuados para entornos de campo y respuesta rápida.
	* ~~Portable instruments suitable for field and rapid-response settings~~.
	~~</div>~~

	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Common_workflow"></span>
	== ~~Common workflow =~~=		== Flujo de trabajo común =
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		# Preparación de muestras y construcción de biblioteca.
	# ~~Sample preparation and library construction~~.		# Secuenciación en un dispositivo de nanoporos.
	# ~~Sequencing on a nanopore device~~.		# Basecalling de la señal cruda a la secuencia de nucleótidos.
	# Basecalling ~~from raw signal to nucleotide sequence~~.		# Control de calidad y filtrado.
	# ~~Quality control and filtering~~.		# Alineamiento, ensamblaje, llamada de variantes o clasificación metagenómica.
	# ~~Alignment~~, ~~assembly~~, ~~variant calling, or metagenomic classification~~.		# Interpretación y reporte.
	# ~~Interpretation and reporting~~.
	~~</div>~~

	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Related_pages"></span>
	== ~~Related pages =~~=		== Páginas relacionadas =
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~
	* [[Oxford Nanopore]]		* [[Oxford Nanopore]]
	* [[MinION]]		* [[MinION]]
	* [[~~Bioinformatics~~]]		* [[Bioinformática]]
	* [[~~Glossary~~]]		* [[Glosario]]
	~~</div>~~

	<languages />		<languages />

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2026-06-28T15:45:00Z

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	<div class="~~plainlinks~~">~~'''Languages:''' [[~~Nanopore sequencing~~\|English]] \| [[Nanopore sequencing/zh\|中文]] \| [[Nanopore sequencing/es\|español]] \| [[Nanopore sequencing/fr\|français]] \| [[Nanopore sequencing/de\|Deutsch]] \| [[Nanopore sequencing/ja\|日本語]]~~</div>		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			= Nanopore sequencing =
			</div>

	= ~~Secuenciación por nanoporo~~ =		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			'''Nanopore sequencing''' is a sequencing approach in which individual DNA or RNA molecules pass through nanopores and produce signal changes that can be interpreted as sequence information.
			</div>

	~~'''Secuenciación por nanoporo''' es un enfoque de secuenciación~~ en ~~el que las moléculas de ADN o ARN individuales pasan a través de nanoporos y producen cambios de señal que pueden interpretarse como información de secuencia.~~		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			== Features ==
			</div>

	== ~~Características =~~=		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			* Long reads that can help with genome assembly and structural variant detection.
			* Real-time data generation and analysis.
			* Direct DNA or RNA sensing in many workflows.
			* Portable instruments suitable for field and rapid-response settings.
			</div>

	* Lecturas largas que pueden ayudar con la ensamblaje del genoma y la detección de variantes estructurales.		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
	* Generación y análisis de datos en ~~tiempo real.~~		== Common workflow ==
	* Sensado directo de ADN o ARN en muchos flujos de trabajo.		</div>
	* Instrumentos portátiles adecuados para entornos de campo y respuesta rápida.

	== ~~Flujo de trabajo común =~~=		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			# Sample preparation and library construction.
			# Sequencing on a nanopore device.
			# Basecalling from raw signal to nucleotide sequence.
			# Quality control and filtering.
			# Alignment, assembly, variant calling, or metagenomic classification.
			# Interpretation and reporting.
			</div>

	~~# Preparación de la muestra y construcción de la biblioteca.~~		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
	~~# Secuenciación~~ en ~~un dispositivo de nanoporo.~~		== Related pages ==
	~~# Conversión de la señal cruda a secuencia de nucleótidos.~~		</div>
	~~# Control de calidad y filtrado.~~
	~~# Alineamiento, ensamblaje, llamada de variantes o clasificación metagenómica.~~
	~~# Interpretación y reporte.~~

	== ~~Páginas relacionadas =~~=		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			* [[Oxford Nanopore]]
			* [[MinION]]
			* [[Bioinformatics]]
			* [[Glossary]]
			</div>

	* [[Oxford Nanopore\|Oxford Nanopore]]		<languages />
	* [[MinION\|MinION]]
	* [[Bioinformática]]
	* [[Glosario]]

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	= Secuenciación por nanoporo =		= Secuenciación por nanoporo =
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	== Páginas relacionadas ==		== Páginas relacionadas ==

	* [[Oxford Nanopore]]		* [[Oxford Nanopore\|Oxford Nanopore]]
	* [[MinION]]		* [[MinION\|MinION]]
	* [[Bioinformática]]		* [[Bioinformática]]
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= Secuenciación por nanoporo =

'''Secuenciación por nanoporo''' es un enfoque de secuenciación en el que las moléculas de ADN o ARN individuales pasan a través de nanoporos y producen cambios de señal que pueden interpretarse como información de secuencia.

== Características ==

* Lecturas largas que pueden ayudar con la ensamblaje del genoma y la detección de variantes estructurales.
* Generación y análisis de datos en tiempo real.
* Sensado directo de ADN o ARN en muchos flujos de trabajo.
* Instrumentos portátiles adecuados para entornos de campo y respuesta rápida.

== Flujo de trabajo común ==

# Preparación de la muestra y construcción de la biblioteca.
# Secuenciación en un dispositivo de nanoporo.
# Conversión de la señal cruda a secuencia de nucleótidos.
# Control de calidad y filtrado.
# Alineamiento, ensamblaje, llamada de variantes o clasificación metagenómica.
# Interpretación y reporte.

== Páginas relacionadas ==

* [[Oxford Nanopore]]
* [[MinION]]
* [[Bioinformática]]
* [[Glosario]]