Nanopore sequencing/de - Revision history

Nano: Machine translation from en via nanopore-translate

2026-07-14T15:22:54Z

Machine translation from en via nanopore-translate

← Older revision		Revision as of 23:22, 14 July 2026
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	* Stellen Sie hochwichtige Schlussfolgerungen möglichst mit unabhängigen Beweisen unter Beweis.		* Stellen Sie hochwichtige Schlussfolgerungen möglichst mit unabhängigen Beweisen unter Beweis.

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== Ausgewählte Arbeiten und Ressourcen ==
	~~== Selected papers and resources~~ ==		* Deamer D, Akeson M, Branton D. „Drei Jahrzehnte der Nanoporen-Sequenzierung“. „Nature Biotechnology“. 2016.
	* Deamer D, Akeson M, Branton D. ~~[https://www~~.~~nature.com/articles/nbt.3423 Three decades of nanopore sequencing]. ''Nature Biotechnology''~~. 2016.		* Jain M et al. [https://www.nature.com/articles/nbt.4060 Nanoporen-Sequenzierung und -Assemblage eines menschlichen Genoms mit ultralangen Sequenzabschnitten]. ''Nature Biotechnology''. 2018.
	* Jain M et al. [https://www.nature.com/articles/nbt.4060 ~~Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra~~-~~long reads~~]. ''Nature Biotechnology''. 2018.		* Wick RR, Judd LM, Holt KE. [https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1727-y Leistung von Tools zur Analyse von Sequenzdaten mit neuronalen Netzwerken für die Oxford Nanopore-Sequenzierung]. ''Genome Biology''. 2019.
	* Wick RR, Judd LM, Holt KE. [https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1727-y ~~Performance of neural network basecalling tools for~~ Oxford Nanopore ~~sequencing~~]. ''Genome Biology''. 2019.		* Wang Y et al. [https://www.nature.com/articles/s41587-021-01108-x Nanoporen-Sequenzierungstechnologie, Bioinformatik und Anwendungen]. ''Nature Biotechnology''. 2021.
	* Wang Y et al. [https://www.nature.com/articles/s41587-021-01108-x ~~Nanopore sequencing technology~~, ~~bioinformatics and applications~~]. ''Nature Biotechnology''. 2021.		* Kovaka S et al. „Zielgerichtete Nanoporen-Sequenzierung durch die Echtzeit-Kartierung von Roh-Elektrosignalen mit UNCALLED“. „Nature Biotechnology“. 2021.
	* Kovaka S et al. ~~[https://www.nature.com/articles/s41587-020~~-~~0731~~-~~9 Targeted nanopore sequencing by real~~-~~time mapping of raw electrical signal with UNCALLED]~~. ~~''Nature Biotechnology''~~. 2021.		* Oxford Nanopore Technologies: [https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado Basecaller und verwandte Tools]
	* Oxford Nanopore Technologies. [https://github.com/nanoporetech/dorado Dorado ~~basecaller and related tools~~].
	~~</div>~~

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== Verwandte Seiten ==
	~~== Related pages~~ ==		* [[Nanopore technology\|Nanoporen-Technologie]]
	* [[Nanopore technology]]		* [[Oxford Nanopore\|Oxford Nanopore]]
	* [[Oxford Nanopore]]		* [[MinION\|'''MinION''']]
	* [[MinION]]		* [[Bioinformatics\|Bioinformatik]]
	* [[Bioinformatics]]		* [[Machine learning\|Maschinelles Lernen]]
	* [[Machine learning]]		* [[Data analysis\|Datenanalyse]]
	* [[Data analysis]]		* [[Event detection\|Ereigniserkennung]]
	* [[Event detection]]		* [[Glossary\|Glossar]]
	* [[Glossary]]
	~~</div>~~

	<languages />		<languages />

Nano: Machine translation from en via nanopore-translate

2026-07-14T14:35:24Z

Machine translation from en via nanopore-translate

← Older revision		Revision as of 22:35, 14 July 2026
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	</div>		</div>

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== Daten und Dateitypen ==
	~~== Data and file types~~ ==		Rohes und verarbeitetes Nanoporen-Datenmaterial kann POD5- oder FAST5-Signaldateien, FASTQ-Daten, BAM- oder CRAM-Alignments, Sequenzierungszusammenfassungsdateien, Modifikationsmarkierungen von Basen sowie Ausführungsberichte enthalten. Gute Analysepraktiken dokumentieren das verwendete Instrument, die Flow-Zelle, die verwendete Chemie, das verwendete Kit, den Basenaufruf-Algorithmus (BaseCaller), die Version des verwendeten Modells, die Referenzdatenbank sowie die Parameter der Befehlszeile.
	~~Raw and processed nanopore data may include~~ POD5 or FAST5 ~~signal files~~, FASTQ ~~reads~~, BAM or CRAM ~~alignments, sequencing~~-~~summary files~~, ~~modified-base tags~~, ~~and run reports~~. ~~Good analysis practice records the instrument~~, ~~flow cell~~, ~~chemistry~~, ~~kit~~, ~~basecaller, model version~~, ~~reference database~~, ~~and command-line parameters~~.
	~~</div>~~

	~~<div lang~~=~~"en" dir~~=~~"ltr" class="mw-content-ltr">~~		== Gute Praxis ==
	~~== Good practice~~ ==		* Vor der Optimierung der Ausbeute muss das Protokoll an die biologische Fragestellung angepasst werden.
	* ~~Match the protocol to the biological question before optimizing yield~~.		* Verwenden Sie Steuerelemente, um die Effekte der Bibliothek, der Poren, der Probe sowie der Analyse voneinander zu trennen.
	* ~~Use controls to separate library~~, ~~pore~~, ~~sample~~, ~~and analysis effects~~.		* Berichten Sie über die Chemie, die verwendete Basistoffanalysemethode (Basecaller), die Modellversion sowie die Analyseparameter.
	* ~~Report chemistry~~, ~~basecaller~~, ~~model version, and analysis parameters~~.		* Überprüfen Sie sowohl repräsentative Auszüge aus dem Text als auch aggregierte Statistiken.
	* ~~Inspect both representative reads and aggregate statistics~~.		* Stellen Sie hochwichtige Schlussfolgerungen möglichst mit unabhängigen Beweisen unter Beweis.
	* ~~Validate high-impact conclusions with independent evidence when possible~~.
	~~</div>~~

	<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">

Nano: Machine translation from en via nanopore-translate

2026-07-14T13:32:43Z

Machine translation from en via nanopore-translate

← Older revision		Revision as of 21:32, 14 July 2026
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	* '''Flexibler Durchsatz''' ermöglicht sowohl kleine, gezielte Durchführungen als auch umfangreichere Projekte im Genomskalenbereich.		* '''Flexibler Durchsatz''' ermöglicht sowohl kleine, gezielte Durchführungen als auch umfangreichere Projekte im Genomskalenbereich.

	~~<div class~~=~~"mw~~-~~translate~~-~~fuzzy">~~		== Einschränkungen und Fehlerquellen ==
	~~== Verwandte Seiten =~~		Die Nanopore-Sequenzierung sollte nicht automatisch als überlegen gegenüber der Sequenzierung mit kurzen Leseabschnitten angesehen werden. Ihre Eignung hängt von der Fragestellung, der Probe, der erforderlichen Genauigkeit, den Kosten sowie dem Analyseverfahren ab. Wichtige Einschränkungen dieser Methode sind unter anderem:
	~~</div>~~		* Rohlesefehler sowie systematische, kontextabhängige Fehler.
			* Eine Empfindlichkeit von Sample-Qualität – insbesondere für Anwendungen, bei denen lange Lesezeiten erforderlich sind.
			* Chemie, Porenstruktur und Abhängigkeit von der Modellversion.
			* Homopolymere und die Interpretation modifizierter Basen in bestimmten Kontexten stellen Herausforderungen dar.
			* Rechenanforderungen für Basiskallierung, Ausrichtung, Zusammenstellung (Assembly) sowie Variantenanalyse (Variant Calling).
			* In klinischen, regulatorischen oder hochbedeutenden Umgebungen sind sorgfältige Kontrollmechanismen erforderlich.

	<div class="mw-translate-fuzzy">		<div class="mw-translate-fuzzy">

FuzzyBot: Updating to match new version of source page

2026-07-14T13:31:24Z

Updating to match new version of source page

@@ Line 1: / Line 1: @@
-<span id="Nanopore_sequencing"></span>
+__NOTOC__
-= Nanoporen-Sequenzierung =
+= Nanopore-Sequenzierung =
-'''Nanoporen-Sequenzierung''' ist ein Sequenzierungsverfahren, bei dem einzelne DNS- oder RNA-Moleküle durch Nanoporen passieren und Signaländerungen erzeugen, die als Sequenzinformation interpretiert werden können.
+Der wissenschaftliche Wert der Nanoporen-Sequenzierung beruht auf vier miteinander verbundenen Eigenschaften: langen Sequenzierergebnissen, Echtzeit-Datenerfassung, direkter elektrischer Messung sowie tragbaren Geräten. Diese Eigenschaften machen die Nanoporen-Sequenzierung für die Genomassemblage, die Analyse struktureller Varianten, die Überwachung von Mikroben, die Reaktion auf Ausbrüche, die Umweltsequenzierung, die Transkriptomik sowie die direkte Erkennung bestimmter Nukleotidmodifikationen besonders nützlich.
-<span id="Features"></span>
+== Prinzip ==
-== Merkmale =
+Eine Nanoporen-Sequenzierungsmessung umfasst drei miteinander verbundene Schichten:
-* Lange Reads, die bei der Genomanalyse und der Detektion struktureller Varianten helfen können.
+Ein einzelner aktueller Zustand („Current Level“) wird in der Regel nicht einer isolierten Basenstruktur zugeordnet. Das gemessene Signal hängt von verschiedenen Faktoren ab, darunter dem lokalen Sequenzkontext, der Chemie der Poren, der Drehgeschwindigkeit des Motors, der Temperatur, dem verwendeten Puffer, der Elektronik sowie der Version des Modells. Aus diesem Grund basieren die Verfahren zur Basenbestimmung („Basecalling“) und zur Erkennung modifizierter Basen auf Modellen – und nicht auf einfachen Abfragetabellen.
-<span id="Common_workflow"></span>
+== Vorgang vom Beispiel zum Ergebnis ==
-== Typischer Workflow =
+{| class="wikitable np-knowledge-table"
-# Probenaufbereitung und Bibliothekserschließung.
+== Stärken ==
-# Sequenzierung auf einem Nanoporen-Gerät.
+* Lange Texte können wiederholte Elemente, strukturelle Varianten, Haplotypen, Plasmide sowie komplexe genomische Regionen umfassen.
-# Basecalling vom rohen Signal zur Nukleotidsequenz.
+* '''Echtzeit-Sequenzierung''' ermöglicht die Analyse während des Laufs eines Prozesses und unterstützt somit eine schnelle Entscheidungsfindung.
-# Qualitätskontrolle und Filterung.
+* Die Methode der '''direkten Sensierung''' (Direct Sensing) kann Informationen über bestimmte Modifikationen von DNA oder RNA erhalten und bewahren.
-# Ausrichtung, Assemblierung, Variante detection oder Metagenom-Klassifizierung.
+* '''Portable Instrumente''' ermöglichen die Arbeit im Feld, im Unterricht sowie in Arbeitsabläufen mit geringer Infrastruktur.
-# Interpretation und Berichterstattung.
+* '''Flexibler Durchsatz''' ermöglicht sowohl kleine, gezielte Durchführungen als auch umfangreichere Projekte im Genomskalenbereich.
-<span id="Related_pages"></span>
+<div class="mw-translate-fuzzy">
 == Verwandte Seiten =
 * [[Oxford Nanopore]]
 * [[MinION]]
 * [[Bioinformatics|Bioinformatik]]
 * [[Glossary|Glossar]]
 <languages />

Nano: Fix translated wiki link targets

2026-06-30T03:13:21Z

Fix translated wiki link targets

← Older revision		Revision as of 11:13, 30 June 2026
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	* [[Oxford Nanopore]]		* [[Oxford Nanopore]]
	* [[MinION]]		* [[MinION]]
	* [[Bioinformatik]]		* [[Bioinformatics\|Bioinformatik]]
	* [[Glossar]]		* [[Glossary\|Glossar]]

	<languages />		<languages />

Nano: Update de translation via SiliconFlow batch

2026-06-29T03:50:31Z

Update de translation via SiliconFlow batch

← Older revision		Revision as of 11:50, 29 June 2026
Line 1:		Line 1:
	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Nanopore_sequencing"></span>
	= ~~Nanopore sequencing~~ =		= Nanoporen-Sequenzierung =
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		'''Nanoporen-Sequenzierung''' ist ein Sequenzierungsverfahren, bei dem einzelne DNS- oder RNA-Moleküle durch Nanoporen passieren und Signaländerungen erzeugen, die als Sequenzinformation interpretiert werden können.
	'''~~Nanopore sequencing~~''' ~~is a sequencing approach in which individual DNA or~~ RNA ~~molecules pass through nanopores and produce signal changes that can be interpreted as sequence information~~.
	~~</div>~~

	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Features"></span>
	== ~~Features =~~=		== Merkmale =
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		* Lange Reads, die bei der Genomanalyse und der Detektion struktureller Varianten helfen können.
	* ~~Long reads that can help with genome assembly and structural variant detection~~.		* Echtzeit-Datenerzeugung und -analyse.
	* ~~Real~~-~~time data generation and analysis~~.		* Direktes DNS- oder RNA-Sensieren in vielen Workflows.
	* ~~Direct DNA or~~ RNA ~~sensing~~ in ~~many workflows~~.		* Portabelle Geräte, die für Einsatz im Feld und bei schnellen Reaktionen geeignet sind.
	* ~~Portable instruments suitable for field and rapid-response settings~~.
	~~</div>~~

	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Common_workflow"></span>
	== ~~Common workflow =~~=		== Typischer Workflow =
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~		# Probenaufbereitung und Bibliothekserschließung.
	# ~~Sample preparation and library construction~~.		# Sequenzierung auf einem Nanoporen-Gerät.
	# ~~Sequencing on a nanopore device~~.		# Basecalling vom rohen Signal zur Nukleotidsequenz.
	# Basecalling ~~from raw signal to nucleotide sequence~~.		# Qualitätskontrolle und Filterung.
	# ~~Quality control and filtering~~.		# Ausrichtung, Assemblierung, Variante detection oder Metagenom-Klassifizierung.
	# ~~Alignment~~, ~~assembly~~, ~~variant calling, or metagenomic classification~~.		# Interpretation und Berichterstattung.
	# Interpretation ~~and reporting~~.
	~~</div>~~

	<~~div lang~~="~~en" dir="ltr" class="mw-content-ltr~~">		<span id="Related_pages"></span>
	== ~~Related pages =~~=		== Verwandte Seiten =
	~~</div>~~

	~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">~~
	* [[Oxford Nanopore]]		* [[Oxford Nanopore]]
	* [[MinION]]		* [[MinION]]
	* [[~~Bioinformatics~~]]		* [[Bioinformatik]]
	* [[~~Glossary~~]]		* [[Glossar]]
	~~</div>~~

	<languages />		<languages />

FuzzyBot: Updating to match new version of source page

2026-06-28T15:22:29Z

Updating to match new version of source page

← Older revision		Revision as of 23:22, 28 June 2026
Line 1:		Line 1:
	<div class="~~plainlinks~~">~~'''Languages:''' [[~~Nanopore sequencing~~\|English]] \| [[Nanopore sequencing/zh\|中文]] \| [[Nanopore sequencing/es\|español]] \| [[Nanopore sequencing/fr\|français]] \| [[Nanopore sequencing/de\|Deutsch]] \| [[Nanopore sequencing/ja\|日本語]]~~</div>		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			= Nanopore sequencing =
			</div>

	= Nanopore~~-Sequenzierung =~~		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			'''Nanopore sequencing''' is a sequencing approach in which individual DNA or RNA molecules pass through nanopores and produce signal changes that can be interpreted as sequence information.
			</div>

	~~'''Nanopore~~-~~Sequenzierung''' ist ein Sequenzierungsverfahren, bei dem einzelne DNS~~- ~~oder RNA-Moleküle durch Nanoporen passieren und Signaländerungen erzeugen, die als Sequenzinformation interpretiert werden können.~~		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			== Features ==
			</div>

	== ~~Merkmale =~~=		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			* Long reads that can help with genome assembly and structural variant detection.
			* Real-time data generation and analysis.
			* Direct DNA or RNA sensing in many workflows.
			* Portable instruments suitable for field and rapid-response settings.
			</div>

	* Lange Reads, die bei der Genomanalyse und der Erkennung struktureller Varianten helfen können.		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
	* Echtzeit-~~Datenerzeugung und~~ -~~analyse.~~		== Common workflow ==
	* Direktes DNS- oder RNA-Erkennen in vielen Arbeitsabläufen.		</div>
	* Portabelle Geräte, die für Einsatz vor Ort und in Krisensituationen geeignet sind.

	== ~~Üblicher Arbeitsablauf =~~=		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			# Sample preparation and library construction.
			# Sequencing on a nanopore device.
			# Basecalling from raw signal to nucleotide sequence.
			# Quality control and filtering.
			# Alignment, assembly, variant calling, or metagenomic classification.
			# Interpretation and reporting.
			</div>

	~~# Probenaufbereitung und Bibliothekserschließung.~~		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
	~~# Sequenzierung auf einem Nanopore~~-~~Gerät.~~		== Related pages ==
	~~# Basecalling vom Rohsignal zum Nukleotidsequenz.~~		</div>
	~~# Qualitätskontrolle und Filterung.~~
	~~# Anpassung, Assemblierung, Variante Erkennung oder Metagenom-Klassifizierung.~~
	~~# Interpretation und Berichterstattung.~~

	== ~~Verwandte Seiten =~~=		<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
			* [[Oxford Nanopore]]
			* [[MinION]]
			* [[Bioinformatics]]
			* [[Glossary]]
			</div>

	* [[Oxford Nanopore\|Oxford Nanopore]]		<languages />
	* [[MinION\|MinION]]
	* [[Bioinformatik]]
	* [[Glossar]]

Nano: Fix language navigation encoding and localized link labels

2026-06-28T13:59:00Z

Fix language navigation encoding and localized link labels

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Line 1:		Line 1:
	<div class="plainlinks">'''Languages:''' [[Nanopore sequencing\|English]] \| [[Nanopore sequencing/zh\|??]] \| [[Nanopore sequencing/es\|~~espa?ol~~]] \| [[Nanopore sequencing/fr\|~~fran?ais~~]] \| [[Nanopore sequencing/de\|Deutsch]] \| [[Nanopore sequencing/ja\|~~???~~]]</div>		<div class="plainlinks">'''Languages:''' [[Nanopore sequencing\|English]] \| [[Nanopore sequencing/zh\|中文]] \| [[Nanopore sequencing/es\|español]] \| [[Nanopore sequencing/fr\|français]] \| [[Nanopore sequencing/de\|Deutsch]] \| [[Nanopore sequencing/ja\|日本語]]</div>

	= Nanopore-Sequenzierung =		= Nanopore-Sequenzierung =
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	== Verwandte Seiten ==		== Verwandte Seiten ==

	* [[Oxford Nanopore]]		* [[Oxford Nanopore\|Oxford Nanopore]]
	* [[MinION]]		* [[MinION\|MinION]]
	* [[Bioinformatik]]		* [[Bioinformatik]]
	* [[Glossar]]		* [[Glossar]]

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= Nanopore-Sequenzierung =

'''Nanopore-Sequenzierung''' ist ein Sequenzierungsverfahren, bei dem einzelne DNS- oder RNA-Moleküle durch Nanoporen passieren und Signaländerungen erzeugen, die als Sequenzinformation interpretiert werden können.

== Merkmale ==

* Lange Reads, die bei der Genomanalyse und der Erkennung struktureller Varianten helfen können.
* Echtzeit-Datenerzeugung und -analyse.
* Direktes DNS- oder RNA-Erkennen in vielen Arbeitsabläufen.
* Portabelle Geräte, die für Einsatz vor Ort und in Krisensituationen geeignet sind.

== Üblicher Arbeitsablauf ==

# Probenaufbereitung und Bibliothekserschließung.
# Sequenzierung auf einem Nanopore-Gerät.
# Basecalling vom Rohsignal zum Nukleotidsequenz.
# Qualitätskontrolle und Filterung.
# Anpassung, Assemblierung, Variante Erkennung oder Metagenom-Klassifizierung.
# Interpretation und Berichterstattung.

== Verwandte Seiten ==

* [[Oxford Nanopore]]
* [[MinION]]
* [[Bioinformatik]]
* [[Glossar]]