Ver el código de «Oxford Nanopore/ru»

__NOTOC__
[[File:Oxford_Nanopore_MinION_top_open.jpg|thumb|right|320px|Приборы Oxford Nanopore популяризировали портативное секвенирование с длинным считыванием.]]
'''Oxford Nanopore''' является частью курса обучения Nanopore Wiki. Oxford Nanopore Technologies разрабатывает инструменты для нанопорового секвенирования, проточные ячейки, химию и программное обеспечение для секвенирования ДНК и РНК в реальном времени.

== Основные понятия ==
* Платформа считывает электрические сигналы, возникающие при прохождении молекул через нанопоры.
* Семейства устройств включают портативные приборы и приборы с более высокой пропускной способностью.
* Результаты могут включать исходные сигналы, риды после basecalling, выравнивания и отчеты об анализе.
* Производительность зависит от химии, качества проточной ячейки, подготовки библиотеки, модели basecalling и настроек анализа.

== Научные основы ==
* Платформа считывает электрические сигналы, возникающие при прохождении молекул через нанопоры.
* Семейства устройств включают портативные приборы и приборы с более высокой пропускной способностью.
* Интерпретации должны быть привязаны к измеримым величинам, экспериментальному контролю и документированным настройкам анализа.
* В утверждениях следует отличать прямые наблюдения от последующих выводов.

== Типичный рабочий процесс секвенирования ==
{| class="wikitable np-knowledge-table"
! Шаг
! Описание
|-
| 1
| Подготовьте библиотеку ДНК или РНК в соответствии с анализом.
|-
| 2
| Загрузите библиотеку в проточную кювету и начните секвенирование.
|-
| 3
| Преобразуйте исходный сигнал в риды и оценки качества с помощью basecalling.
|-
| 4
| Выполните контроль качества, согласование, сборку, вызов вариантов, вызов модификаций или классификацию.
|}

== Типичные применения ==
* Секвенирование длинного считывания генома.
* Метагеномика и надзор за патогенами.
* Транскриптомика и прямое секвенирование РНК.
* Обнаружение структурных вариантов и модификаций.

== Проверки качества ==
* Запишите платформу, тип пор или проточной ячейки, химический состав, напряжение или настройки сбора данных, а также версии программного обеспечения.
* Используйте отрицательные контроли, положительные контроли и повторяйте измерения, если утверждение зависит от специфичности.
* Укажите ограничения, включая шум, систематические смещения, деградацию образца, нестабильность пор и зависимость анализа от модели.
* Не рассматривайте спецификации поставщика как замену проверки для конкретного приложения.

== Ограничения интерпретации ==
* Сравнение результатов без химического анализа и версий модели.
* Игнорирование качества считывания, количества пор, выхода анализа и деградации образца.
* Отдельный результат не следует обобщать, выходя за рамки используемого образца, протокола, состояния прибора и конвейера анализа.
* Медицинские, юридические, нормативные или коммерческие решения требуют проверки в конкретной области, выходящей за рамки данного образовательного обзора.

== Связанные страницы ==
* [[MinION]]
* [[Nanopore sequencing|Нанопоровое секвенирование]]
* [[Bioinformatics|Биоинформатика]]
* [[Platforms|Платформы]]

== Литература ==
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Oxford_Nanopore_Technologies Оксфордские нанопоровые технологии]
* [https://nanoporetech.com/ Официальный сайт Oxford Nanopore Technologies]

<languages />